RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246139.9

CITED1-201, Transcript of Cbp/p300 interacting transactivator with Glu/Asp rich carboxy-terminal domain 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CITED1, Length 1,231 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.67□□□□□ -1.18
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CITED1-201ENST00000246139 MT1GP13640 62 aa7.54□□□□□ -1.2
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CITED1-201ENST00000246139 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.5□□□□□ -1.21
CITED1-201ENST00000246139 LCE1DQ5T752 114 aa7.5□□□□□ -1.21
CITED1-201ENST00000246139 PP632Q6XCG6 107 aa7.5□□□□□ -1.21
CITED1-201ENST00000246139 MT1LQ93083 61 aa7.44□□□□□ -1.22
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CITED1-201ENST00000246139 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.16□□□□□ -1.26
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CITED1-201ENST00000246139 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.15□□□□□ -1.26
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CITED1-201ENST00000246139 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
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CITED1-201ENST00000246139 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.72□□□□□ -1.33
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CITED1-201ENST00000246139 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.66□□□□□ -1.34
CITED1-201ENST00000246139 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.66□□□□□ -1.34
CITED1-201ENST00000246139 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
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CITED1-201ENST00000246139 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.29□□□□□ -1.4
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.26□□□□□ -1.41
CITED1-201ENST00000246139 PRAC1Q96KF2 57 aa6.22□□□□□ -1.41
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.21□□□□□ -1.42
CITED1-201ENST00000246139 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.2□□□□□ -1.42
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CITED1-201ENST00000246139 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.13□□□□□ -1.43
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP5-8O75690 187 aa6.11□□□□□ -1.43
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.03□□□□□ -1.44
CITED1-201ENST00000246139 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.02□□□□□ -1.45
CITED1-201ENST00000246139 SVIPQ8NHG7 77 aa5.96□□□□□ -1.46
CITED1-201ENST00000246139 MT3P25713 68 aa5.8□□□□□ -1.48
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.8□□□□□ -1.48
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CITED1-201ENST00000246139 LCE1CQ5T751 118 aa4.92□□□□□ -1.62
CITED1-201ENST00000246139 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.81□□□□□ -1.64
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.73□□□□□ -1.65
CITED1-201ENST00000246139 NDUFAF8A1L188 74 aa4.67□□□□□ -1.66
CITED1-201ENST00000246139 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.55□□□□□ -1.68
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.44□□□□□ -1.7
CITED1-201ENST00000246139 LCE1FQ5T754 118 aa4.36□□□□□ -1.71
CITED1-201ENST00000246139 PHGR1C9JFL3 82 aa4.17□□□□□ -1.74
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.13□□□□□ -1.75
CITED1-201ENST00000246139 A0A0A0MQY5 61 aa4.1□□□□□ -1.75
CITED1-201ENST00000246139 INE1O15225 51 aa3.94□□□□□ -1.78
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.84□□□□□ -1.79
CITED1-201ENST00000246139 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.75□□□□□ -1.81
CITED1-201ENST00000246139 PRM1P04553 51 aa3.63□□□□□ -1.83
CITED1-201ENST00000246139 H3BS24 57 aa3.53□□□□□ -1.84
CITED1-201ENST00000246139 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.14□□□□□ -1.91
CITED1-201ENST00000246139 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.3 ms