RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 K7ERS5 55 aa8.01□□□□□ -1.13
SYF2-201ENST00000236273 MT1GP13640 62 aa7.97□□□□□ -1.13
SYF2-201ENST00000236273 MT1LQ93083 61 aa7.97□□□□□ -1.13
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.93□□□□□ -1.14
SYF2-201ENST00000236273 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
SYF2-201ENST00000236273 MT1MQ8N339 61 aa7.86□□□□□ -1.15
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP12-3P60328 96 aa7.83□□□□□ -1.16
SYF2-201ENST00000236273 LOC100996750A0A140TA64 210 aa7.82□□□□□ -1.16
SYF2-201ENST00000236273 PP632Q6XCG6 107 aa7.82□□□□□ -1.16
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.82□□□□□ -1.16
SYF2-201ENST00000236273 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.76□□□□□ -1.17
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.71□□□□□ -1.18
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.69□□□□□ -1.18
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.63□□□□□ -1.19
SYF2-201ENST00000236273 ROMO1P60602 79 aa7.61□□□□□ -1.19
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.46□□□□□ -1.22
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.43□□□□□ -1.22
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.39□□□□□ -1.23
SYF2-201ENST00000236273 LCE4AQ5TA78 99 aa7.36□□□□□ -1.23
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.36□□□□□ -1.23
SYF2-201ENST00000236273 LCE1DQ5T752 114 aa7.31□□□□□ -1.24
SYF2-201ENST00000236273 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.27□□□□□ -1.25
SYF2-201ENST00000236273 MT4P47944 62 aa7.25□□□□□ -1.25
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SYF2-201ENST00000236273 HMCN1Q96RW7 5635 aa7.21□□□□□ -1.26
SYF2-201ENST00000236273 BRK1Q8WUW1 75 aa7.18□□□□□ -1.26
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.94□□□□□ -1.3
SYF2-201ENST00000236273 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
SYF2-201ENST00000236273 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.91□□□□□ -1.3
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa6.89□□□□□ -1.31
SYF2-201ENST00000236273 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.87□□□□□ -1.31
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP12-4P60329 112 aa6.85□□□□□ -1.31
SYF2-201ENST00000236273 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.81□□□□□ -1.32
SYF2-201ENST00000236273 PMAIP1Q13794 54 aa6.77□□□□□ -1.32
SYF2-201ENST00000236273 MT1AP04731 61 aa6.76□□□□□ -1.33
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa6.75□□□□□ -1.33
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.73□□□□□ -1.33
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.67□□□□□ -1.34
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.64□□□□□ -1.35
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.59□□□□□ -1.35
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.59□□□□□ -1.35
SYF2-201ENST00000236273 PRAC1Q96KF2 57 aa6.53□□□□□ -1.36
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP5-2Q701N4 177 aa6.5□□□□□ -1.37
SYF2-201ENST00000236273 PRO0628Q9UI54 55 aa6.5□□□□□ -1.37
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.36□□□□□ -1.39
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.35□□□□□ -1.39
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa6.22□□□□□ -1.41
SYF2-201ENST00000236273 MT3P25713 68 aa6.15□□□□□ -1.43
SYF2-201ENST00000236273 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.15□□□□□ -1.43
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.08□□□□□ -1.44
SYF2-201ENST00000236273 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.04□□□□□ -1.44
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP5-8O75690 187 aa6.02□□□□□ -1.45
SYF2-201ENST00000236273 H3BS24 57 aa5.79□□□□□ -1.48
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa5.78□□□□□ -1.48
SYF2-201ENST00000236273 SVIPQ8NHG7 77 aa5.78□□□□□ -1.48
SYF2-201ENST00000236273 MUC5ACP98088 5654 aa5.65□□□□□ -1.5
SYF2-201ENST00000236273 LCE1EQ5T753 118 aa5.6□□□□□ -1.51
SYF2-201ENST00000236273 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP5.58□□□□□ -1.52
SYF2-201ENST00000236273 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP5.47□□□□□ -1.53
SYF2-201ENST00000236273 LUZP6Q538Z0 58 aa5.34□□□□□ -1.55
SYF2-201ENST00000236273 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.27□□□□□ -1.57
SYF2-201ENST00000236273 LCE1BQ5T7P3 118 aa5.22□□□□□ -1.57
SYF2-201ENST00000236273 LCE1CQ5T751 118 aa5.21□□□□□ -1.58
SYF2-201ENST00000236273 LCE3EQ5T5B0 92 aa5.01□□□□□ -1.61
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.79□□□□□ -1.64
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.69□□□□□ -1.66
SYF2-201ENST00000236273 NDUFAF8A1L188 74 aa4.58□□□□□ -1.68
SYF2-201ENST00000236273 LCE1FQ5T754 118 aa4.46□□□□□ -1.69
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.46□□□□□ -1.7
SYF2-201ENST00000236273 PHGR1C9JFL3 82 aa4.05□□□□□ -1.76
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa4.01□□□□□ -1.77
SYF2-201ENST00000236273 PRM1P04553 51 aa3.93□□□□□ -1.78
SYF2-201ENST00000236273 INE1O15225 51 aa3.69□□□□□ -1.82
SYF2-201ENST00000236273 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.68□□□□□ -1.82
SYF2-201ENST00000236273 A0A0A0MQY5 61 aa3.64□□□□□ -1.83
SYF2-201ENST00000236273 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa2.88□□□□□ -1.95
SYF2-201ENST00000236273 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.6□□□□□ -1.99
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 168.2 ms