RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219479.6

NME4-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME4, Length 995 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-201ENST00000219479 LCE3AQ5TA76 89 aa7.8□□□□□ -1.16
NME4-201ENST00000219479 UQCR11O14957 56 aa7.76□□□□□ -1.17
NME4-201ENST00000219479 MT4P47944 62 aa7.74□□□□□ -1.17
NME4-201ENST00000219479 MT1LQ93083 61 aa7.74□□□□□ -1.17
NME4-201ENST00000219479 LCE4AQ5TA78 99 aa7.73□□□□□ -1.17
NME4-201ENST00000219479 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa7.71□□□□□ -1.18
NME4-201ENST00000219479 MT1MQ8N339 61 aa7.7□□□□□ -1.18
NME4-201ENST00000219479 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.58□□□□□ -1.2
NME4-201ENST00000219479 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa7.58□□□□□ -1.2
NME4-201ENST00000219479 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa7.53□□□□□ -1.2
NME4-201ENST00000219479 K7ERS5 55 aa7.52□□□□□ -1.21
NME4-201ENST00000219479 KRTAP12-3P60328 96 aa7.52□□□□□ -1.21
NME4-201ENST00000219479 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa7.51□□□□□ -1.21
NME4-201ENST00000219479 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.48□□□□□ -1.21
NME4-201ENST00000219479 V9GYY9 64 aa7.47□□□□□ -1.21
NME4-201ENST00000219479 PSPHP1O15172 72 aa7.44□□□□□ -1.22
NME4-201ENST00000219479 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.44□□□□□ -1.22
NME4-201ENST00000219479 Q1T7F1 81 aa7.36□□□□□ -1.23
NME4-201ENST00000219479 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa7.35□□□□□ -1.23
NME4-201ENST00000219479 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.34□□□□□ -1.23
NME4-201ENST00000219479 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa7.29□□□□□ -1.24
NME4-201ENST00000219479 A6NED7 52 aa7.22□□□□□ -1.25
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NME4-201ENST00000219479 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.08□□□□□ -1.28
NME4-201ENST00000219479 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.07□□□□□ -1.28
NME4-201ENST00000219479 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
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NME4-201ENST00000219479 ROMO1P60602 79 aa6.93□□□□□ -1.3
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NME4-201ENST00000219479 KRTAP5-8O75690 187 aa6.42□□□□□ -1.38
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NME4-201ENST00000219479 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa6.27□□□□□ -1.41
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NME4-201ENST00000219479 OBSCNQ5VST9 7968 aa6.21□□□□□ -1.42
NME4-201ENST00000219479 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.15□□□□□ -1.42
NME4-201ENST00000219479 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.11□□□□□ -1.43
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NME4-201ENST00000219479 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.01□□□□□ -1.61
NME4-201ENST00000219479 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa4.93□□□□□ -1.62
NME4-201ENST00000219479 LUZP6Q538Z0 58 aa4.8□□□□□ -1.64
NME4-201ENST00000219479 NDUFAF8A1L188 74 aa4.76□□□□□ -1.65
NME4-201ENST00000219479 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.71□□□□□ -1.66
NME4-201ENST00000219479 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.68□□□□□ -1.66
NME4-201ENST00000219479 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.63□□□□□ -1.67
NME4-201ENST00000219479 LCE1FQ5T754 118 aa4.62□□□□□ -1.67
NME4-201ENST00000219479 PHGR1C9JFL3 82 aa4.43□□□□□ -1.7
NME4-201ENST00000219479 INE1O15225 51 aa4.3□□□□□ -1.72
NME4-201ENST00000219479 KRTAP21-2Q3LI59 83 aa4.28□□□□□ -1.72
NME4-201ENST00000219479 KRTAP4-4Q9BYR3 166 aa3.96□□□□□ -1.78
NME4-201ENST00000219479 MUC19Q7Z5P9 8384 aa3.85□□□□□ -1.79
NME4-201ENST00000219479 PRM1P04553 51 aa3.54□□□□□ -1.84
NME4-201ENST00000219479 KRTAP21-1Q3LI58 79 aa3.36□□□□□ -1.87
NME4-201ENST00000219479 MUC16Q8WXI7 14507 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 77 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.7 ms