RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000640507.1

SPIN3-240, Transcript of spindlin family member 3, humanhuman

TSL 5

Gene SPIN3, Length 1,436 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIN3-240ENST00000640507 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SPIN3-240ENST00000640507 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.35□□□□□ -1.23
SPIN3-240ENST00000640507 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.35□□□□□ -1.23
SPIN3-240ENST00000640507 C1orf64Q8NEQ6 169 aa7.35□□□□□ -1.23
SPIN3-240ENST00000640507 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa7.35□□□□□ -1.23
SPIN3-240ENST00000640507 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.35□□□□□ -1.23
SPIN3-240ENST00000640507 A0A087WVE0 104 aa7.34□□□□□ -1.23
SPIN3-240ENST00000640507 C5orf47Q569G3 176 aa7.33□□□□□ -1.24
SPIN3-240ENST00000640507 S4R3F8 94 aa7.32□□□□□ -1.24
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SPIN3-240ENST00000640507 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.23□□□□□ -1.25
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SPIN3-240ENST00000640507 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.88□□□□□ -1.31
SPIN3-240ENST00000640507 DMAC1Q96GE9 116 aa6.82□□□□□ -1.32
SPIN3-240ENST00000640507 LCE4AQ5TA78 99 aa6.81□□□□□ -1.32
SPIN3-240ENST00000640507 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SPIN3-240ENST00000640507 P0C880 135 aa6.73□□□□□ -1.33
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SPIN3-240ENST00000640507 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.52□□□□□ -1.37
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SPIN3-240ENST00000640507 KRTAP12-2P59991 146 aa6.5□□□□□ -1.37
SPIN3-240ENST00000640507 COA5Q86WW8 74 aa6.5□□□□□ -1.37
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SPIN3-240ENST00000640507 MDN1Q9NU22 5596 aa6.4□□□□□ -1.38
SPIN3-240ENST00000640507 Q1T7F1 81 aa6.37□□□□□ -1.39
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SPIN3-240ENST00000640507 SPRR2BP35325 72 aa6.34□□□□□ -1.39
SPIN3-240ENST00000640507 SPRR2AP35326 72 aa6.34□□□□□ -1.39
SPIN3-240ENST00000640507 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
SPIN3-240ENST00000640507 V9GYY9 64 aa6.33□□□□□ -1.4
SPIN3-240ENST00000640507 KRTAP10-12P60413 245 aa6.32□□□□□ -1.4
SPIN3-240ENST00000640507 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.3□□□□□ -1.4
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SPIN3-240ENST00000640507 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.28□□□□□ -1.4
SPIN3-240ENST00000640507 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.28□□□□□ -1.4
SPIN3-240ENST00000640507 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.27□□□□□ -1.41
SPIN3-240ENST00000640507 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.27□□□□□ -1.41
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SPIN3-240ENST00000640507 PRR15LQ9BU68 103 aa6.22□□□□□ -1.41
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SPIN3-240ENST00000640507 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.17□□□□□ -1.42
SPIN3-240ENST00000640507 SPRR2DP22532 72 aa6.14□□□□□ -1.43
SPIN3-240ENST00000640507 A0A1B0GU69 56 aa6.13□□□□□ -1.43
SPIN3-240ENST00000640507 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.1□□□□□ -1.43
SPIN3-240ENST00000640507 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.1□□□□□ -1.43
SPIN3-240ENST00000640507 A0A0D9SG42 100 aa6.08□□□□□ -1.44
SPIN3-240ENST00000640507 A0A1B0GU33 70 aa6.08□□□□□ -1.44
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