RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610893.4

LTBP4-232, Transcript of latent transforming growth factor beta binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene LTBP4, Length 578 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4-232ENST00000610893 A0A087WVE0 104 aa8.75□□□□□ -1.01
LTBP4-232ENST00000610893 IMUPQ9GZP8 106 aa8.73□□□□□ -1.01
LTBP4-232ENST00000610893 UQCRQO14949 82 aa8.7□□□□□ -1.02
LTBP4-232ENST00000610893 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.7□□□□□ -1.02
LTBP4-232ENST00000610893 ATOX1O00244 68 aa8.69□□□□□ -1.02
LTBP4-232ENST00000610893 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.68□□□□□ -1.02
LTBP4-232ENST00000610893 PCP4L1A6NKN8 68 aa8.68□□□□□ -1.02
LTBP4-232ENST00000610893 NDUFC1O43677 76 aa8.67□□□□□ -1.02
LTBP4-232ENST00000610893 H0YAA0 97 aa8.66□□□□□ -1.02
LTBP4-232ENST00000610893 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
LTBP4-232ENST00000610893 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.65□□□□□ -1.02
LTBP4-232ENST00000610893 H0Y9P7 68 aa8.65□□□□□ -1.02
LTBP4-232ENST00000610893 A8MUN3 132 aa8.6□□□□□ -1.03
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP5-9P26371 169 aa8.58□□□□□ -1.04
LTBP4-232ENST00000610893 LINC00643Q86TS7 51 aa8.52□□□□□ -1.05
LTBP4-232ENST00000610893 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.51□□□□□ -1.05
LTBP4-232ENST00000610893 LINC00208Q96KT6 92 aa8.51□□□□□ -1.05
LTBP4-232ENST00000610893 KMT2DO14686 5537 aa8.51□□□□□ -1.05
LTBP4-232ENST00000610893 MP68P56378 58 aa8.46□□□□□ -1.06
LTBP4-232ENST00000610893 MDN1Q9NU22 5596 aa8.45□□□□□ -1.06
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.44□□□□□ -1.06
LTBP4-232ENST00000610893 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.44□□□□□ -1.06
LTBP4-232ENST00000610893 OCR1Q9BZK8 76 aa8.42□□□□□ -1.06
LTBP4-232ENST00000610893 PLAC4Q8WY50 150 aa8.38□□□□□ -1.07
LTBP4-232ENST00000610893 MT1XP80297 61 aa8.34□□□□□ -1.07
LTBP4-232ENST00000610893 C20orf197Q8N268 126 aa8.34□□□□□ -1.07
LTBP4-232ENST00000610893 R4GN34 69 aa8.34□□□□□ -1.07
LTBP4-232ENST00000610893 H3BPC8 53 aa8.33□□□□□ -1.08
LTBP4-232ENST00000610893 P0C880 135 aa8.28□□□□□ -1.08
LTBP4-232ENST00000610893 DMAC1Q96GE9 116 aa8.26□□□□□ -1.09
LTBP4-232ENST00000610893 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.26□□□□□ -1.09
LTBP4-232ENST00000610893 M0QZ58 72 aa8.24□□□□□ -1.09
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.22□□□□□ -1.09
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.22□□□□□ -1.09
LTBP4-232ENST00000610893 SCGB1A1P11684 91 aa8.21□□□□□ -1.1
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP12-2P59991 146 aa8.21□□□□□ -1.1
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.2□□□□□ -1.1
LTBP4-232ENST00000610893 J3QR89 54 aa8.19□□□□□ -1.1
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.19□□□□□ -1.1
LTBP4-232ENST00000610893 A0A1B0GV90 55 aa8.18□□□□□ -1.1
LTBP4-232ENST00000610893 SPRR2EP22531 72 aa8.17□□□□□ -1.1
LTBP4-232ENST00000610893 SPRR2BP35325 72 aa8.17□□□□□ -1.1
LTBP4-232ENST00000610893 SPRR2AP35326 72 aa8.17□□□□□ -1.1
LTBP4-232ENST00000610893 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.12□□□□□ -1.11
LTBP4-232ENST00000610893 LINC01554Q52M75 96 aa8.12□□□□□ -1.11
LTBP4-232ENST00000610893 ACYP2P14621 99 aa8.06□□□□□ -1.12
LTBP4-232ENST00000610893 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.06□□□□□ -1.12
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.03□□□□□ -1.12
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.03□□□□□ -1.12
LTBP4-232ENST00000610893 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.02□□□□□ -1.13
LTBP4-232ENST00000610893 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.96□□□□□ -1.14
LTBP4-232ENST00000610893 MT-ATP8P03928 68 aa7.95□□□□□ -1.14
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.95□□□□□ -1.14
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.95□□□□□ -1.14
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.94□□□□□ -1.14
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP10-12P60413 245 aa7.94□□□□□ -1.14
LTBP4-232ENST00000610893 SPRR2DP22532 72 aa7.91□□□□□ -1.14
LTBP4-232ENST00000610893 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa7.89□□□□□ -1.15
LTBP4-232ENST00000610893 K7ERU9 68 aa7.8□□□□□ -1.16
LTBP4-232ENST00000610893 SNURFQ9Y675 71 aa7.75□□□□□ -1.17
LTBP4-232ENST00000610893 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.74□□□□□ -1.17
LTBP4-232ENST00000610893 LCE3BQ5TA77 95 aa7.71□□□□□ -1.18
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.65□□□□□ -1.18
LTBP4-232ENST00000610893 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.64□□□□□ -1.19
LTBP4-232ENST00000610893 SERP2Q8N6R1 65 aa7.6□□□□□ -1.19
LTBP4-232ENST00000610893 SEC61GP60059 68 aa7.49□□□□□ -1.21
LTBP4-232ENST00000610893 COA5Q86WW8 74 aa7.49□□□□□ -1.21
LTBP4-232ENST00000610893 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.47□□□□□ -1.21
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.46□□□□□ -1.22
LTBP4-232ENST00000610893 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.44□□□□□ -1.22
LTBP4-232ENST00000610893 A0A0D9SG42 100 aa7.41□□□□□ -1.22
LTBP4-232ENST00000610893 MT1EP04732 61 aa7.4□□□□□ -1.22
LTBP4-232ENST00000610893 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.39□□□□□ -1.23
LTBP4-232ENST00000610893 A0A1B0GU33 70 aa7.36□□□□□ -1.23
LTBP4-232ENST00000610893 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.36□□□□□ -1.23
LTBP4-232ENST00000610893 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.34□□□□□ -1.23
LTBP4-232ENST00000610893 COX7CP15954 63 aa7.29□□□□□ -1.24
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP12-1P59990 96 aa7.27□□□□□ -1.25
LTBP4-232ENST00000610893 MT1GP13640 62 aa7.23□□□□□ -1.25
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.23□□□□□ -1.25
LTBP4-232ENST00000610893 H7BZZ5 65 aa7.22□□□□□ -1.25
LTBP4-232ENST00000610893 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.22□□□□□ -1.25
LTBP4-232ENST00000610893 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.2□□□□□ -1.26
LTBP4-232ENST00000610893 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.19□□□□□ -1.26
LTBP4-232ENST00000610893 PP632Q6XCG6 107 aa7.18□□□□□ -1.26
LTBP4-232ENST00000610893 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.16□□□□□ -1.26
LTBP4-232ENST00000610893 A0A1B0GU69 56 aa7.14□□□□□ -1.27
LTBP4-232ENST00000610893 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.11□□□□□ -1.27
LTBP4-232ENST00000610893 MT1MQ8N339 61 aa7.06□□□□□ -1.28
LTBP4-232ENST00000610893 MT1LQ93083 61 aa7.05□□□□□ -1.28
LTBP4-232ENST00000610893 A8MU10 97 aa7.04□□□□□ -1.28
LTBP4-232ENST00000610893 LCE1DQ5T752 114 aa7.02□□□□□ -1.29
LTBP4-232ENST00000610893 LCE4AQ5TA78 99 aa7.02□□□□□ -1.29
LTBP4-232ENST00000610893 TNP1P09430 55 aa7.01□□□□□ -1.29
LTBP4-232ENST00000610893 LCE3AQ5TA76 89 aa6.97□□□□□ -1.29
LTBP4-232ENST00000610893 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.97□□□□□ -1.29
LTBP4-232ENST00000610893 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.93□□□□□ -1.3
LTBP4-232ENST00000610893 MT4P47944 62 aa6.91□□□□□ -1.3
LTBP4-232ENST00000610893 PRR15LQ9BU68 103 aa6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.1 ms