RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 CCDC179H3BU77 68 aa4.09□□□□□ -1.75
CS-216ENST00000549221 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.09□□□□□ -1.75
CS-216ENST00000549221 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.07□□□□□ -1.76
CS-216ENST00000549221 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.06□□□□□ -1.76
CS-216ENST00000549221 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
CS-216ENST00000549221 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.05□□□□□ -1.76
CS-216ENST00000549221 FAM236CP0DP71 79 aa4.05□□□□□ -1.76
CS-216ENST00000549221 H7BZZ5 65 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-216ENST00000549221 V9GYY9 64 aa4.03□□□□□ -1.76
CS-216ENST00000549221 MT1HP80294 61 aa4.02□□□□□ -1.77
CS-216ENST00000549221 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4□□□□□ -1.77
CS-216ENST00000549221 SSPOA2VEC9 5147 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-216ENST00000549221 DMAC1Q96GE9 116 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-216ENST00000549221 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.99□□□□□ -1.77
CS-216ENST00000549221 RPS28P62857 69 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
CS-216ENST00000549221 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-216ENST00000549221 PRO0628Q9UI54 55 aa3.98□□□□□ -1.77
CS-216ENST00000549221 NDUFC1O43677 76 aa3.97□□□□□ -1.77
CS-216ENST00000549221 A8MUN3 132 aa3.96□□□□□ -1.78
CS-216ENST00000549221 LCA10Q71F78 164 aa3.95□□□□□ -1.78
CS-216ENST00000549221 S4R3F8 94 aa3.94□□□□□ -1.78
CS-216ENST00000549221 M0R2T5 61 aa3.91□□□□□ -1.78
CS-216ENST00000549221 ACYP2P14621 99 aa3.91□□□□□ -1.78
CS-216ENST00000549221 USH2AO75445 5202 aa3.91□□□□□ -1.78
CS-216ENST00000549221 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
CS-216ENST00000549221 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
CS-216ENST00000549221 TMEM258P61165 79 aa3.89□□□□□ -1.79
CS-216ENST00000549221 COA5Q86WW8 74 aa3.88□□□□□ -1.79
CS-216ENST00000549221 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.88□□□□□ -1.79
CS-216ENST00000549221 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.86□□□□□ -1.79
CS-216ENST00000549221 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.86□□□□□ -1.79
CS-216ENST00000549221 CSAG1Q6PB30 78 aa3.85□□□□□ -1.79
CS-216ENST00000549221 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-216ENST00000549221 LCE3BQ5TA77 95 aa3.84□□□□□ -1.79
CS-216ENST00000549221 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.83□□□□□ -1.8
CS-216ENST00000549221 MT2AP02795 61 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-216ENST00000549221 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa3.83□□□□□ -1.8
CS-216ENST00000549221 MT1FP04733 61 aa3.82□□□□□ -1.8
CS-216ENST00000549221 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.77□□□□□ -1.81
CS-216ENST00000549221 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.77□□□□□ -1.81
CS-216ENST00000549221 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.77□□□□□ -1.81
CS-216ENST00000549221 NEBP20929 6669 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-216ENST00000549221 H0YAA0 97 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-216ENST00000549221 KRTAP10-10P60014 251 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-216ENST00000549221 PMAIP1Q13794 54 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-216ENST00000549221 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.76□□□□□ -1.81
CS-216ENST00000549221 P0C880 135 aa3.75□□□□□ -1.81
CS-216ENST00000549221 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.73□□□□□ -1.81
CS-216ENST00000549221 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-216ENST00000549221 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-216ENST00000549221 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa3.7□□□□□ -1.82
CS-216ENST00000549221 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.67□□□□□ -1.82
CS-216ENST00000549221 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.66□□□□□ -1.82
CS-216ENST00000549221 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.66□□□□□ -1.82
CS-216ENST00000549221 SMIM26A0A096LP01 95 aa3.65□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 SPRR2GQ9BYE4 73 aa3.65□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 A0A1B0GU69 56 aa3.64□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.64□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa3.63□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 CRIPTQ9P021 101 aa3.63□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 Q1T7F1 81 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 BRK1Q8WUW1 75 aa3.62□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 M0QZ58 72 aa3.61□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 PRR15LQ9BU68 103 aa3.61□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 R4GN34 69 aa3.61□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 A0A1B0GU33 70 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 PSPHP1O15172 72 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.59□□□□□ -1.83
CS-216ENST00000549221 GPR98Q8WXG9 6306 aa3.59□□□□□ -1.84
CS-216ENST00000549221 MT1BP07438 61 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-216ENST00000549221 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-216ENST00000549221 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.58□□□□□ -1.84
CS-216ENST00000549221 LCE1DQ5T752 114 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-216ENST00000549221 Q5VV11 94 aa3.57□□□□□ -1.84
CS-216ENST00000549221 A0A0A0MQY5 61 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-216ENST00000549221 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-216ENST00000549221 LINC01554Q52M75 96 aa3.56□□□□□ -1.84
CS-216ENST00000549221 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.53□□□□□ -1.84
CS-216ENST00000549221 A0A0D9SG42 100 aa3.52□□□□□ -1.85
CS-216ENST00000549221 A8MU10 97 aa3.52□□□□□ -1.85
CS-216ENST00000549221 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.52□□□□□ -1.85
CS-216ENST00000549221 KMT2DO14686 5537 aa3.49□□□□□ -1.85
CS-216ENST00000549221 UQCR11O14957 56 aa3.49□□□□□ -1.85
CS-216ENST00000549221 KRTAP12-1P59990 96 aa3.47□□□□□ -1.85
CS-216ENST00000549221 LCE4AQ5TA78 99 aa3.47□□□□□ -1.85
CS-216ENST00000549221 A6NN06 94 aa3.46□□□□□ -1.86
CS-216ENST00000549221 MIR22HGQ0VDD5 57 aa3.46□□□□□ -1.86
CS-216ENST00000549221 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa3.46□□□□□ -1.86
CS-216ENST00000549221 MDN1Q9NU22 5596 aa3.46□□□□□ -1.86
CS-216ENST00000549221 A6NED7 52 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-216ENST00000549221 KRTAP12-2P59991 146 aa3.45□□□□□ -1.86
CS-216ENST00000549221 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.44□□□□□ -1.86
CS-216ENST00000549221 PLAC4Q8WY50 150 aa3.44□□□□□ -1.86
CS-216ENST00000549221 MT1XP80297 61 aa3.43□□□□□ -1.86
CS-216ENST00000549221 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.42□□□□□ -1.86
CS-216ENST00000549221 KRTAP10-5P60370 271 aa3.41□□□□□ -1.86
CS-216ENST00000549221 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.39□□□□□ -1.87
CS-216ENST00000549221 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.39□□□□□ -1.87
CS-216ENST00000549221 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa3.37□□□□□ -1.87
CS-216ENST00000549221 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa3.36□□□□□ -1.87
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