RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534160.1

GMDS-AS1-212, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GMDS-AS1, Length 720 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RAB37Q96AX2 223 aa2.34□□□□□ -2.03
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM218A2RU14 115 aa2.33□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa2.32□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa2.32□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.32□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa2.31□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SNCGO76070 127 aa2.31□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LCA10Q71F78 164 aa2.31□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRR15Q8IV56 129 aa2.31□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A1B0GV72 72 aa2.3□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TRACP01848 142 aa2.3□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FABP2P12104 132 aa2.3□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MT1XP80297 61 aa2.3□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CSAG1Q6PB30 78 aa2.3□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ANKRD29Q8N6D5 301 aa2.29□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 S4R3F8 94 aa2.29□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.28□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CRIPTQ9P021 101 aa2.28□□□□□ -2.04
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NDUFB1O75438 58 aa2.27□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CCKP06307 115 aa2.27□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MT4P47944 62 aa2.27□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C4orf26Q17RF5 130 aa2.27□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 J3KT08 172 aa2.26□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.26□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.26□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.26□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CLLU1Q5K131 121 aa2.25□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC01545Q5VT33 79 aa2.25□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 VPS25Q9BRG1 176 aa2.25□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PLAC4Q8WY50 150 aa2.24□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 H0YGX0 51 aa2.22□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 APOC3P02656 99 aa2.22□□□□□ -2.05
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PDE6GP18545 87 aa2.21□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A8MUN3 132 aa2.2□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 K7EQZ3 153 aa2.2□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTDAPP60985 99 aa2.2□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NDUFA5Q16718 116 aa2.2□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ATOH7Q8N100 152 aa2.2□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 SVBPQ8N300 66 aa2.2□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.2□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A1B0GX51 115 aa2.19□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DNAL4O96015 105 aa2.19□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.19□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 ORMDL1Q9P0S3 153 aa2.18□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.16□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 hDV103S1A0JD37 113 aa2.16□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa2.16□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 Q6ZQT0 140 aa2.16□□□□□ -2.06
GMDS-AS1-212ENST00000534160 COA5Q86WW8 74 aa2.14□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa2.13□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.13□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C9JAW5 83 aa2.12□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 H0YAA0 97 aa2.11□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HCG22E2RYF7 251 aa2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST1H2BKO60814 126 aa2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST1H2BJP06899 126 aa2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST1H2BOP23527 126 aa2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST1H2BBP33778 126 aa2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST1H2BDP58876 126 aa2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST1H2BCP62807 126 aa2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST2H2BEQ16778 126 aa2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST1H2BHQ93079 126 aa2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST1H2BNQ99877 126 aa2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST1H2BMQ99879 126 aa2.1□□□□□ -2.07
GMDS-AS1-212ENST00000534160 TMEM258P61165 79 aa2.08□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LINC01554Q52M75 96 aa2.08□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 PRO1854Q9UHT4 67 aa2.08□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MUC5ACP98088 5654 aa2.07□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A087WVE0 104 aa2.07□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NREPQ16612 68 aa2.07□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 M0QZ58 72 aa2.06□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 NDUFC1O43677 76 aa2.06□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MT1EP04732 61 aa2.06□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 S100A6P06703 90 aa2.06□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 CASC2Q6XLA1 102 aa2.06□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MUC5BQ9HC84 5762 aaPredicted RBP2.05□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 A0A1B0GW54 56 aa2.05□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 COX6CP09669 75 aa2.05□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa2.05□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 COX8AP10176 69 aa2.03□□□□□ -2.08
GMDS-AS1-212ENST00000534160 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.02□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MT1GP13640 62 aa2.02□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.02□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BAALC-AS2P0C853 105 aa2.01□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa2.01□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C20orf197Q8N268 126 aa2.01□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa2□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 K7ERJ3 54 aa2□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 FXYD2P54710 66 aa2□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C14orf132Q9NPU4 83 aa2□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 DLEU1O43261 78 aa1.99□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 BATFQ16520 125 aa1.99□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 MT1MQ8N339 61 aa1.99□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 C14orf144Q96I85 54 aa1.99□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 HIGD1BQ9P298 99 aa1.99□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 K7EP34 96 aa1.98□□□□□ -2.09
GMDS-AS1-212ENST00000534160 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.98□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.9 ms