RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 A0A087WVE0 104 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-212ENST00000484841 NDUFC1O43677 76 aa8.84□□□□□ -0.99
ACTB-212ENST00000484841 ACYP1P07311 99 aa8.83□□□□□ -1
ACTB-212ENST00000484841 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.82□□□□□ -1
ACTB-212ENST00000484841 ATOX1O00244 68 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-212ENST00000484841 UQCRQO14949 82 aa8.8□□□□□ -1
ACTB-212ENST00000484841 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-212ENST00000484841 NEBP20929 6669 aa8.79□□□□□ -1
ACTB-212ENST00000484841 H0Y9P7 68 aa8.78□□□□□ -1
ACTB-212ENST00000484841 H0YAA0 97 aa8.73□□□□□ -1.01
ACTB-212ENST00000484841 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.71□□□□□ -1.02
ACTB-212ENST00000484841 A8MUN3 132 aa8.7□□□□□ -1.02
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP5-9P26371 169 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa8.69□□□□□ -1.02
ACTB-212ENST00000484841 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-212ENST00000484841 MUC12Q9UKN1 5478 aa8.68□□□□□ -1.02
ACTB-212ENST00000484841 LINC00208Q96KT6 92 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-212ENST00000484841 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.63□□□□□ -1.03
ACTB-212ENST00000484841 MP68P56378 58 aa8.6□□□□□ -1.03
ACTB-212ENST00000484841 PLAC4Q8WY50 150 aa8.58□□□□□ -1.04
ACTB-212ENST00000484841 LINC00643Q86TS7 51 aa8.57□□□□□ -1.04
ACTB-212ENST00000484841 C20orf197Q8N268 126 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-212ENST00000484841 R4GN34 69 aa8.51□□□□□ -1.05
ACTB-212ENST00000484841 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.47□□□□□ -1.05
ACTB-212ENST00000484841 KMT2DO14686 5537 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-212ENST00000484841 OCR1Q9BZK8 76 aa8.46□□□□□ -1.06
ACTB-212ENST00000484841 MT1XP80297 61 aa8.43□□□□□ -1.06
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GV90 55 aa8.42□□□□□ -1.06
ACTB-212ENST00000484841 M0QZ58 72 aa8.41□□□□□ -1.06
ACTB-212ENST00000484841 H3BPC8 53 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-212ENST00000484841 SPRR2EP22531 72 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-212ENST00000484841 SPRR2BP35325 72 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-212ENST00000484841 SPRR2AP35326 72 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa8.4□□□□□ -1.06
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-212ENST00000484841 MDN1Q9NU22 5596 aa8.39□□□□□ -1.07
ACTB-212ENST00000484841 P0C880 135 aa8.38□□□□□ -1.07
ACTB-212ENST00000484841 SCGB1A1P11684 91 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-212ENST00000484841 DMAC1Q96GE9 116 aa8.34□□□□□ -1.07
ACTB-212ENST00000484841 LINC01554Q52M75 96 aa8.33□□□□□ -1.08
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP12-2P59991 146 aa8.31□□□□□ -1.08
ACTB-212ENST00000484841 J3QR89 54 aa8.27□□□□□ -1.09
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.22□□□□□ -1.09
ACTB-212ENST00000484841 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.21□□□□□ -1.1
ACTB-212ENST00000484841 LCE1AQ5T7P2 110 aa8.19□□□□□ -1.1
ACTB-212ENST00000484841 ACYP2P14621 99 aa8.18□□□□□ -1.1
ACTB-212ENST00000484841 SPTSSBQ8NFR3 76 aa8.18□□□□□ -1.1
ACTB-212ENST00000484841 MT-ATP8P03928 68 aa8.17□□□□□ -1.1
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa8.15□□□□□ -1.1
ACTB-212ENST00000484841 SPRR2DP22532 72 aa8.13□□□□□ -1.11
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa8.13□□□□□ -1.11
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa8.13□□□□□ -1.11
ACTB-212ENST00000484841 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa8.07□□□□□ -1.12
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP10-12P60413 245 aa8.02□□□□□ -1.13
ACTB-212ENST00000484841 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.02□□□□□ -1.13
ACTB-212ENST00000484841 K7ERU9 68 aa8.01□□□□□ -1.13
ACTB-212ENST00000484841 LCE3BQ5TA77 95 aa7.91□□□□□ -1.14
ACTB-212ENST00000484841 SNURFQ9Y675 71 aa7.84□□□□□ -1.15
ACTB-212ENST00000484841 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.83□□□□□ -1.16
ACTB-212ENST00000484841 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.77□□□□□ -1.17
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.71□□□□□ -1.18
ACTB-212ENST00000484841 SEC61GP60059 68 aa7.66□□□□□ -1.18
ACTB-212ENST00000484841 SERP1Q9Y6X1 66 aa7.63□□□□□ -1.19
ACTB-212ENST00000484841 SERP2Q8N6R1 65 aa7.62□□□□□ -1.19
ACTB-212ENST00000484841 A0A0D9SG42 100 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-212ENST00000484841 COA5Q86WW8 74 aa7.57□□□□□ -1.2
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa7.53□□□□□ -1.2
ACTB-212ENST00000484841 LCE5AQ5TCM9 118 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-212ENST00000484841 SPINT4Q6UDR6 99 aa7.52□□□□□ -1.21
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.51□□□□□ -1.21
ACTB-212ENST00000484841 MT1EP04732 61 aa7.5□□□□□ -1.21
ACTB-212ENST00000484841 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.47□□□□□ -1.21
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GU33 70 aa7.46□□□□□ -1.22
ACTB-212ENST00000484841 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-212ENST00000484841 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.38□□□□□ -1.23
ACTB-212ENST00000484841 PP632Q6XCG6 107 aa7.35□□□□□ -1.23
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.34□□□□□ -1.23
ACTB-212ENST00000484841 MT1GP13640 62 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-212ENST00000484841 COX7CP15954 63 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP12-1P59990 96 aa7.33□□□□□ -1.24
ACTB-212ENST00000484841 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.28□□□□□ -1.24
ACTB-212ENST00000484841 A0A1B0GU69 56 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-212ENST00000484841 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.27□□□□□ -1.25
ACTB-212ENST00000484841 GPR98Q8WXG9 6306 aa7.24□□□□□ -1.25
ACTB-212ENST00000484841 H7BZZ5 65 aa7.23□□□□□ -1.25
ACTB-212ENST00000484841 LCE1DQ5T752 114 aa7.18□□□□□ -1.26
ACTB-212ENST00000484841 MT1MQ8N339 61 aa7.17□□□□□ -1.26
ACTB-212ENST00000484841 LCE4AQ5TA78 99 aa7.16□□□□□ -1.26
ACTB-212ENST00000484841 TNP1P09430 55 aa7.15□□□□□ -1.26
ACTB-212ENST00000484841 A8MU10 97 aa7.14□□□□□ -1.27
ACTB-212ENST00000484841 MT1LQ93083 61 aa7.13□□□□□ -1.27
ACTB-212ENST00000484841 MT4P47944 62 aa7.12□□□□□ -1.27
ACTB-212ENST00000484841 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.09□□□□□ -1.27
ACTB-212ENST00000484841 LCE3AQ5TA76 89 aa7.08□□□□□ -1.28
ACTB-212ENST00000484841 CCDC179H3BU77 68 aa7.05□□□□□ -1.28
ACTB-212ENST00000484841 PRR15LQ9BU68 103 aa7.02□□□□□ -1.29
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