RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000431908.5

DDX39B-210, Transcript of DExD-box helicase 39B, humanhuman

TSL 5

Gene DDX39B, Length 914 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39B-210ENST00000431908 C4orf26Q17RF5 130 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-210ENST00000431908 C1orf64Q8NEQ6 169 aa5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-210ENST00000431908 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.97□□□□□ -1.45
DDX39B-210ENST00000431908 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.96□□□□□ -1.46
DDX39B-210ENST00000431908 C8orf87E5RJ46 101 aa5.96□□□□□ -1.46
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DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.92□□□□□ -1.46
DDX39B-210ENST00000431908 MT2AP02795 61 aa5.92□□□□□ -1.46
DDX39B-210ENST00000431908 NDUFS5O43920 106 aa5.9□□□□□ -1.46
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DDX39B-210ENST00000431908 V9GYY9 64 aa5.85□□□□□ -1.47
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DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa5.82□□□□□ -1.48
DDX39B-210ENST00000431908 Q5W150 140 aa5.8□□□□□ -1.48
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DDX39B-210ENST00000431908 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
DDX39B-210ENST00000431908 IGKV2-30P06310 120 aa5.74□□□□□ -1.49
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DDX39B-210ENST00000431908 DMAC1Q96GE9 116 aa5.69□□□□□ -1.5
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DDX39B-210ENST00000431908 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.65□□□□□ -1.5
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DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.64□□□□□ -1.51
DDX39B-210ENST00000431908 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
DDX39B-210ENST00000431908 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.61□□□□□ -1.51
DDX39B-210ENST00000431908 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.6□□□□□ -1.51
DDX39B-210ENST00000431908 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.6□□□□□ -1.51
DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa5.56□□□□□ -1.52
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DDX39B-210ENST00000431908 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.52□□□□□ -1.53
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DDX39B-210ENST00000431908 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.33□□□□□ -1.56
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DDX39B-210ENST00000431908 MT1BP07438 61 aa5.32□□□□□ -1.56
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DDX39B-210ENST00000431908 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa5.31□□□□□ -1.56
DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.3□□□□□ -1.56
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DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.24□□□□□ -1.57
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DDX39B-210ENST00000431908 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.17□□□□□ -1.58
DDX39B-210ENST00000431908 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.13□□□□□ -1.59
DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa5.1□□□□□ -1.59
DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.09□□□□□ -1.59
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DDX39B-210ENST00000431908 PLAC4Q8WY50 150 aa5.07□□□□□ -1.6
DDX39B-210ENST00000431908 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.06□□□□□ -1.6
DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa5.06□□□□□ -1.6
DDX39B-210ENST00000431908 K7ERS5 55 aa5.05□□□□□ -1.6
DDX39B-210ENST00000431908 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.05□□□□□ -1.6
DDX39B-210ENST00000431908 SPRR2EP22531 72 aa5.03□□□□□ -1.6
DDX39B-210ENST00000431908 SPRR2BP35325 72 aa5.03□□□□□ -1.6
DDX39B-210ENST00000431908 SPRR2AP35326 72 aa5.03□□□□□ -1.6
DDX39B-210ENST00000431908 KMT2DO14686 5537 aa5.02□□□□□ -1.61
DDX39B-210ENST00000431908 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.01□□□□□ -1.61
DDX39B-210ENST00000431908 PRAC1Q96KF2 57 aa5.01□□□□□ -1.61
DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.99□□□□□ -1.61
DDX39B-210ENST00000431908 R4GN34 69 aa4.99□□□□□ -1.61
DDX39B-210ENST00000431908 MDN1Q9NU22 5596 aa4.98□□□□□ -1.61
DDX39B-210ENST00000431908 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.97□□□□□ -1.61
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