RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380751.9

SERF1B-202, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SERF1B, Length 703 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERF1B-202ENST00000380751 H3BT86 120 aa7.69□□□□□ -1.18
SERF1B-202ENST00000380751 KLKP1Q107X0 134 aa7.68□□□□□ -1.18
SERF1B-202ENST00000380751 TSTD3H0UI37 97 aa7.66□□□□□ -1.18
SERF1B-202ENST00000380751 BATFQ16520 125 aa7.63□□□□□ -1.19
SERF1B-202ENST00000380751 IMUPQ9GZP8 106 aa7.6□□□□□ -1.19
SERF1B-202ENST00000380751 C9orf118A6NHY6 69 aa7.59□□□□□ -1.19
SERF1B-202ENST00000380751 A0A1W2PPM0 123 aa7.57□□□□□ -1.2
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa7.56□□□□□ -1.2
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa7.56□□□□□ -1.2
SERF1B-202ENST00000380751 TAX1BP3O14907 124 aa7.54□□□□□ -1.2
SERF1B-202ENST00000380751 CRIPTQ9P021 101 aa7.52□□□□□ -1.21
SERF1B-202ENST00000380751 UBL5Q9BZL1 73 aa7.51□□□□□ -1.21
SERF1B-202ENST00000380751 A0A087WVE0 104 aa7.5□□□□□ -1.21
SERF1B-202ENST00000380751 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.49□□□□□ -1.21
SERF1B-202ENST00000380751 SMIM6P0DI80 62 aa7.46□□□□□ -1.22
SERF1B-202ENST00000380751 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.44□□□□□ -1.22
SERF1B-202ENST00000380751 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.44□□□□□ -1.22
SERF1B-202ENST00000380751 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.44□□□□□ -1.22
SERF1B-202ENST00000380751 SPRR2EP22531 72 aa7.41□□□□□ -1.22
SERF1B-202ENST00000380751 SPRR2BP35325 72 aa7.41□□□□□ -1.22
SERF1B-202ENST00000380751 SPRR2AP35326 72 aa7.41□□□□□ -1.22
SERF1B-202ENST00000380751 PRO0461Q9UI25 63 aa7.35□□□□□ -1.23
SERF1B-202ENST00000380751 H0YAA0 97 aa7.32□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 MT1XP80297 61 aa7.32□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.32□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 K7EP34 96 aa7.31□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 NDUFC1O43677 76 aa7.31□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.3□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.29□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa7.29□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa7.29□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.28□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 A8MUN3 132 aa7.28□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.28□□□□□ -1.24
SERF1B-202ENST00000380751 LCE1AQ5T7P2 110 aa7.27□□□□□ -1.25
SERF1B-202ENST00000380751 PLAC4Q8WY50 150 aa7.24□□□□□ -1.25
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP12-2P59991 146 aa7.18□□□□□ -1.26
SERF1B-202ENST00000380751 ACYP1P07311 99 aa7.17□□□□□ -1.26
SERF1B-202ENST00000380751 SPRR2DP22532 72 aa7.17□□□□□ -1.26
SERF1B-202ENST00000380751 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.16□□□□□ -1.26
SERF1B-202ENST00000380751 H0Y9P7 68 aa7.14□□□□□ -1.27
SERF1B-202ENST00000380751 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.13□□□□□ -1.27
SERF1B-202ENST00000380751 UQCRQO14949 82 aa7.12□□□□□ -1.27
SERF1B-202ENST00000380751 ETDBQ3ZM63 59 aa7.12□□□□□ -1.27
SERF1B-202ENST00000380751 ATOX1O00244 68 aa7.1□□□□□ -1.27
SERF1B-202ENST00000380751 R4GN34 69 aa7.1□□□□□ -1.27
SERF1B-202ENST00000380751 F8W1H4 67 aa7.09□□□□□ -1.27
SERF1B-202ENST00000380751 P0C880 135 aa7.07□□□□□ -1.28
SERF1B-202ENST00000380751 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa7.06□□□□□ -1.28
SERF1B-202ENST00000380751 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
SERF1B-202ENST00000380751 M0QZ58 72 aa7.04□□□□□ -1.28
SERF1B-202ENST00000380751 LINC00208Q96KT6 92 aa7.01□□□□□ -1.29
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
SERF1B-202ENST00000380751 LINC01554Q52M75 96 aa6.98□□□□□ -1.29
SERF1B-202ENST00000380751 C20orf197Q8N268 126 aa6.98□□□□□ -1.29
SERF1B-202ENST00000380751 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.96□□□□□ -1.29
SERF1B-202ENST00000380751 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.96□□□□□ -1.3
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP10-12P60413 245 aa6.94□□□□□ -1.3
SERF1B-202ENST00000380751 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.88□□□□□ -1.31
SERF1B-202ENST00000380751 MP68P56378 58 aa6.88□□□□□ -1.31
SERF1B-202ENST00000380751 OCR1Q9BZK8 76 aa6.85□□□□□ -1.31
SERF1B-202ENST00000380751 DMAC1Q96GE9 116 aa6.81□□□□□ -1.32
SERF1B-202ENST00000380751 LINC00643Q86TS7 51 aa6.79□□□□□ -1.32
SERF1B-202ENST00000380751 MT-ATP8P03928 68 aa6.74□□□□□ -1.33
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.73□□□□□ -1.33
SERF1B-202ENST00000380751 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.73□□□□□ -1.33
SERF1B-202ENST00000380751 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.33
SERF1B-202ENST00000380751 H3BPC8 53 aa6.71□□□□□ -1.34
SERF1B-202ENST00000380751 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.65□□□□□ -1.34
SERF1B-202ENST00000380751 ACYP2P14621 99 aa6.6□□□□□ -1.35
SERF1B-202ENST00000380751 SCGB1A1P11684 91 aa6.56□□□□□ -1.36
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.55□□□□□ -1.36
SERF1B-202ENST00000380751 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.55□□□□□ -1.36
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.52□□□□□ -1.37
SERF1B-202ENST00000380751 MT1EP04732 61 aa6.51□□□□□ -1.37
SERF1B-202ENST00000380751 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.48□□□□□ -1.37
SERF1B-202ENST00000380751 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.46□□□□□ -1.38
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.46□□□□□ -1.38
SERF1B-202ENST00000380751 HMCN1Q96RW7 5635 aa6.43□□□□□ -1.38
SERF1B-202ENST00000380751 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.4□□□□□ -1.38
SERF1B-202ENST00000380751 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa6.33□□□□□ -1.4
SERF1B-202ENST00000380751 MT1GP13640 62 aa6.33□□□□□ -1.4
SERF1B-202ENST00000380751 A0A1B0GV90 55 aa6.32□□□□□ -1.4
SERF1B-202ENST00000380751 J3QR89 54 aa6.32□□□□□ -1.4
SERF1B-202ENST00000380751 MT4P47944 62 aa6.32□□□□□ -1.4
SERF1B-202ENST00000380751 A0A0D9SG42 100 aa6.31□□□□□ -1.4
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.3□□□□□ -1.4
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa6.27□□□□□ -1.41
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.26□□□□□ -1.41
SERF1B-202ENST00000380751 PP632Q6XCG6 107 aa6.26□□□□□ -1.41
SERF1B-202ENST00000380751 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.25□□□□□ -1.41
SERF1B-202ENST00000380751 SNURFQ9Y675 71 aa6.25□□□□□ -1.41
SERF1B-202ENST00000380751 MT1MQ8N339 61 aa6.22□□□□□ -1.41
SERF1B-202ENST00000380751 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.17□□□□□ -1.42
SERF1B-202ENST00000380751 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.17□□□□□ -1.42
SERF1B-202ENST00000380751 MT1LQ93083 61 aa6.16□□□□□ -1.42
SERF1B-202ENST00000380751 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.14□□□□□ -1.43
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa6.13□□□□□ -1.43
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa6.13□□□□□ -1.43
SERF1B-202ENST00000380751 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa6.1□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.9 ms