RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000566497.5

MFGE8-215, Transcript of milk fat globule-EGF factor 8 protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene MFGE8, Length 1,689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFGE8-215ENST00000566497 H3BPC8 53 aa9.59□□□□□ -0.87
MFGE8-215ENST00000566497 NDUFB1O75438 58 aa9.59□□□□□ -0.87
MFGE8-215ENST00000566497 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
MFGE8-215ENST00000566497 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
MFGE8-215ENST00000566497 MP68P56378 58 aa9.57□□□□□ -0.88
MFGE8-215ENST00000566497 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa9.57□□□□□ -0.88
MFGE8-215ENST00000566497 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa9.56□□□□□ -0.88
MFGE8-215ENST00000566497 IGLV7-43P04211 117 aa9.56□□□□□ -0.88
MFGE8-215ENST00000566497 CD164Q04900 197 aa9.56□□□□□ -0.88
MFGE8-215ENST00000566497 MOBPQ13875 183 aa9.55□□□□□ -0.88
MFGE8-215ENST00000566497 C1orf64Q8NEQ6 169 aa9.53□□□□□ -0.88
MFGE8-215ENST00000566497 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
MFGE8-215ENST00000566497 TRAV22A0A0B4J277 110 aa9.5□□□□□ -0.89
MFGE8-215ENST00000566497 H0Y9P7 68 aa9.49□□□□□ -0.89
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MFGE8-215ENST00000566497 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
MFGE8-215ENST00000566497 LINC00208Q96KT6 92 aa9.48□□□□□ -0.89
MFGE8-215ENST00000566497 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa9.48□□□□□ -0.89
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MFGE8-215ENST00000566497 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.46□□□□□ -0.89
MFGE8-215ENST00000566497 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.46□□□□□ -0.89
MFGE8-215ENST00000566497 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa9.46□□□□□ -0.9
MFGE8-215ENST00000566497 HSPG2P98160 4391 aa9.45□□□□□ -0.9
MFGE8-215ENST00000566497 LIMD2Q9BT23 127 aa9.45□□□□□ -0.9
MFGE8-215ENST00000566497 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
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MFGE8-215ENST00000566497 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa9.3□□□□□ -0.92
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MFGE8-215ENST00000566497 Q75L30 129 aa9.29□□□□□ -0.92
MFGE8-215ENST00000566497 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
MFGE8-215ENST00000566497 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa9.28□□□□□ -0.92
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MFGE8-215ENST00000566497 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa9.24□□□□□ -0.93
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MFGE8-215ENST00000566497 MT1HL1P0DM35 61 aa9□□□□□ -0.97
MFGE8-215ENST00000566497 TNXBP22105 4242 aa8.97□□□□□ -0.97
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MFGE8-215ENST00000566497 DMAC1Q96GE9 116 aa8.96□□□□□ -0.98
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MFGE8-215ENST00000566497 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
MFGE8-215ENST00000566497 PCLOQ9Y6V0 5065 aa8.84□□□□□ -0.99
MFGE8-215ENST00000566497 SPINK7P58062 85 aa8.82□□□□□ -1
MFGE8-215ENST00000566497 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.78□□□□□ -1
MFGE8-215ENST00000566497 A8MUU9 505 aa8.77□□□□□ -1.01
MFGE8-215ENST00000566497 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.77□□□□□ -1.01
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