RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497815.5

CUX1-210, Transcript of cut like homeobox 1, humanhuman

TSL 2

Gene CUX1, Length 947 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX1-210ENST00000497815 ETDBQ3ZM63 59 aa6.61□□□□□ -1.35
CUX1-210ENST00000497815 Q96NJ1 140 aa6.61□□□□□ -1.35
CUX1-210ENST00000497815 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.61□□□□□ -1.35
CUX1-210ENST00000497815 C9orf92A6NGG3 77 aa6.6□□□□□ -1.35
CUX1-210ENST00000497815 CDIP1Q9H305 208 aa6.6□□□□□ -1.35
CUX1-210ENST00000497815 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.59□□□□□ -1.35
CUX1-210ENST00000497815 SIGMAR1Q99720 223 aa6.59□□□□□ -1.35
CUX1-210ENST00000497815 LPAP08519 4548 aa6.59□□□□□ -1.35
CUX1-210ENST00000497815 A0A1B0GW54 56 aa6.58□□□□□ -1.36
CUX1-210ENST00000497815 IGKV4-1P06312 121 aa6.58□□□□□ -1.36
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CUX1-210ENST00000497815 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.5□□□□□ -1.37
CUX1-210ENST00000497815 LCE1DQ5T752 114 aa6.5□□□□□ -1.37
CUX1-210ENST00000497815 LINC00846Q9NV44 126 aa6.5□□□□□ -1.37
CUX1-210ENST00000497815 DSCR10P59022 87 aa6.49□□□□□ -1.37
CUX1-210ENST00000497815 Q6ZVQ6 151 aa6.49□□□□□ -1.37
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CUX1-210ENST00000497815 LINC00313P59037 77 aa6.45□□□□□ -1.38
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CUX1-210ENST00000497815 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.44□□□□□ -1.38
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CUX1-210ENST00000497815 PCOTHQ58A44 107 aa6.39□□□□□ -1.39
CUX1-210ENST00000497815 Q75L30 129 aa6.37□□□□□ -1.39
CUX1-210ENST00000497815 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.37□□□□□ -1.39
CUX1-210ENST00000497815 A8MUU9 505 aa6.36□□□□□ -1.39
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CUX1-210ENST00000497815 J3QR89 54 aa6.35□□□□□ -1.39
CUX1-210ENST00000497815 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.35□□□□□ -1.39
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CUX1-210ENST00000497815 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.31□□□□□ -1.4
CUX1-210ENST00000497815 CASC2Q6XLA1 102 aa6.3□□□□□ -1.4
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CUX1-210ENST00000497815 FAM236CP0DP71 79 aa6.04□□□□□ -1.44
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CUX1-210ENST00000497815 MT1HP80294 61 aa5.98□□□□□ -1.45
CUX1-210ENST00000497815 ATOX1O00244 68 aa5.97□□□□□ -1.45
CUX1-210ENST00000497815 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa5.96□□□□□ -1.46
CUX1-210ENST00000497815 C4orf26Q17RF5 130 aa5.96□□□□□ -1.46
CUX1-210ENST00000497815 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa5.96□□□□□ -1.46
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