RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SZRD1-208ENST00000476423 H3BPC8 53 aa4.72□□□□□ -1.65
SZRD1-208ENST00000476423 IGKV4-1P06312 121 aa4.72□□□□□ -1.65
SZRD1-208ENST00000476423 C6orf99Q4VX62 202 aa4.72□□□□□ -1.65
SZRD1-208ENST00000476423 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.72□□□□□ -1.65
SZRD1-208ENST00000476423 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.72□□□□□ -1.65
SZRD1-208ENST00000476423 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.72□□□□□ -1.65
SZRD1-208ENST00000476423 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.72□□□□□ -1.65
SZRD1-208ENST00000476423 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
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SZRD1-208ENST00000476423 A0A087X002 238 aa4.69□□□□□ -1.66
SZRD1-208ENST00000476423 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.69□□□□□ -1.66
SZRD1-208ENST00000476423 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.69□□□□□ -1.66
SZRD1-208ENST00000476423 M0R378 163 aa4.69□□□□□ -1.66
SZRD1-208ENST00000476423 SYCNQ0VAF6 134 aa4.69□□□□□ -1.66
SZRD1-208ENST00000476423 DIRC1Q969H9 104 aa4.69□□□□□ -1.66
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SZRD1-208ENST00000476423 Q6ZQY7 126 aa4.68□□□□□ -1.66
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SZRD1-208ENST00000476423 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.67□□□□□ -1.66
SZRD1-208ENST00000476423 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
SZRD1-208ENST00000476423 C1orf137Q5JT78 98 aa4.67□□□□□ -1.66
SZRD1-208ENST00000476423 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.67□□□□□ -1.66
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SZRD1-208ENST00000476423 IGLV7-43P04211 117 aa4.64□□□□□ -1.67
SZRD1-208ENST00000476423 MP68P56378 58 aa4.64□□□□□ -1.67
SZRD1-208ENST00000476423 KIAA0087Q14695 138 aa4.64□□□□□ -1.67
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SZRD1-208ENST00000476423 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.63□□□□□ -1.67
SZRD1-208ENST00000476423 A6NN06 94 aa4.63□□□□□ -1.67
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SZRD1-208ENST00000476423 A8MUN3 132 aa4.61□□□□□ -1.67
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SZRD1-208ENST00000476423 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.48□□□□□ -1.69
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SZRD1-208ENST00000476423 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.48□□□□□ -1.69
SZRD1-208ENST00000476423 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
SZRD1-208ENST00000476423 H0Y9P7 68 aa4.47□□□□□ -1.69
SZRD1-208ENST00000476423 LINC01554Q52M75 96 aa4.47□□□□□ -1.69
SZRD1-208ENST00000476423 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.47□□□□□ -1.69
SZRD1-208ENST00000476423 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.47□□□□□ -1.69
SZRD1-208ENST00000476423 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.46□□□□□ -1.7
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