RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460236.5

PHF20L1-211, Transcript of PHD finger protein 20 like 1, humanhuman

TSL 5

Gene PHF20L1, Length 3,393 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20L1-211ENST00000460236 PKHD1P08F94 4074 aa3.47□□□□□ -1.85
PHF20L1-211ENST00000460236 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.47□□□□□ -1.85
PHF20L1-211ENST00000460236 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.85
PHF20L1-211ENST00000460236 BCE1O60756 84 aa3.46□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.46□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 OCR1Q9BZK8 76 aa3.45□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa3.45□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa3.44□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.44□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 FAT1Q14517 4588 aa3.44□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.44□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 A8MUU9 505 aa3.44□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 PRR4Q16378 134 aa3.44□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 SPINK6Q6UWN8 80 aa3.44□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.44□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 A0A1W2PNM2 257 aa3.43□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 CASC2Q6XLA1 102 aa3.43□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.43□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 SPRR1AP35321 89 aa3.43□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 Q8N9L7 120 aa3.43□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa3.43□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 A0A087WSZ3 146 aa3.43□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 ZNF861PO60384 105 aa3.42□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 IGLV7-43P04211 117 aa3.42□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 RYR3Q15413 4870 aa3.42□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.42□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 UBL5Q9BZL1 73 aa3.42□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.42□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 NREPQ16612 68 aa3.42□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 BPY2O14599 106 aa3.41□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 LCE2CQ5TA81 110 aa3.4□□□□□ -1.86
PHF20L1-211ENST00000460236 SPINK7P58062 85 aa3.4□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 IGFL1Q6UW32 110 aa3.4□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.4□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 RYR2Q92736 4967 aa3.4□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 DNAH8Q96JB1 4490 aa3.39□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 SPRR4Q96PI1 79 aa3.39□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.39□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 A0A087X002 238 aa3.39□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 SMIM29Q86T20 159 aa3.38□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.38□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 A0A1B0GVX0 72 aa3.38□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 LINC00483Q53H64 154 aa3.38□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 Q8NBF4 154 aa3.38□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.37□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa3.36□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 K7ERS5 55 aa3.36□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa3.36□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 A0A1B0GVY2 172 aa3.36□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 Q6ZSA8 131 aa3.36□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 PKD1P98161 4303 aa3.36□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 WFDC13Q8IUB5 93 aa3.35□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 TYMSOSQ8TAI1 123 aa3.35□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 Q5VSD8 79 aa3.35□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.35□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 H3BQ85 93 aa3.35□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa3.35□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 PDE6GP18545 87 aa3.34□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa3.34□□□□□ -1.87
PHF20L1-211ENST00000460236 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa3.34□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 IGKV4-1P06312 121 aa3.34□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP23-1A1A580 65 aa3.33□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.33□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa3.32□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.32□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa3.32□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 K7EQZ3 153 aa3.32□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.31□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 SPRR1BP22528 89 aa3.29□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 A0A1B0GW54 56 aa3.28□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 NDUFB1O75438 58 aa3.28□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 MYCBP2O75592 4640 aa3.28□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.28□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 Q8N1X5 172 aa3.28□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 LINC00304Q8N9R0 145 aa3.28□□□□□ -1.88
PHF20L1-211ENST00000460236 C9orf92A6NGG3 77 aa3.28□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 DSCR10P59022 87 aa3.26□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.26□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 RYR1P21817 5038 aa3.26□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa3.26□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.26□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.26□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.25□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 LINC00208Q96KT6 92 aa3.25□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.25□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 HSPG2P98160 4391 aa3.24□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.24□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.23□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 H3BPC8 53 aa3.23□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 LINC00472Q9H8W2 130 aa3.23□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 Q96NJ1 140 aa3.21□□□□□ -1.89
PHF20L1-211ENST00000460236 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PHF20L1-211ENST00000460236 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms