RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 ROMO1P60602 79 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-203ENST00000439720 LINC01556Q5JQF7 62 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-203ENST00000439720 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-203ENST00000439720 STAB1Q9NY15 2570 aa5.12□□□□□ -1.59
RABGEF1-203ENST00000439720 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-203ENST00000439720 DNAH10OSP0CZ25 163 aa5.11□□□□□ -1.59
RABGEF1-203ENST00000439720 Q6ZR54 194 aa5.1□□□□□ -1.59
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RABGEF1-203ENST00000439720 RTL8CO15255 209 aa5.1□□□□□ -1.59
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RABGEF1-203ENST00000439720 Q96NJ1 140 aa5.04□□□□□ -1.6
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RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GVX0 72 aa5.01□□□□□ -1.61
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RABGEF1-203ENST00000439720 K7ERS5 55 aa4.95□□□□□ -1.62
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RABGEF1-203ENST00000439720 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.94□□□□□ -1.62
RABGEF1-203ENST00000439720 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.94□□□□□ -1.62
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RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.93□□□□□ -1.62
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RABGEF1-203ENST00000439720 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.93□□□□□ -1.62
RABGEF1-203ENST00000439720 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-203ENST00000439720 RYR3Q15413 4870 aa4.92□□□□□ -1.62
RABGEF1-203ENST00000439720 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.91□□□□□ -1.62
RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa4.9□□□□□ -1.62
RABGEF1-203ENST00000439720 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-203ENST00000439720 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.89□□□□□ -1.63
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GVY2 172 aa4.88□□□□□ -1.63
RABGEF1-203ENST00000439720 A8MUU9 505 aa4.88□□□□□ -1.63
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RABGEF1-203ENST00000439720 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-203ENST00000439720 ANAPC11Q9NYG5 84 aa4.87□□□□□ -1.63
RABGEF1-203ENST00000439720 C14orf177Q52M58 125 aa4.87□□□□□ -1.63
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RABGEF1-203ENST00000439720 IGLV7-43P04211 117 aa4.84□□□□□ -1.63
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RABGEF1-203ENST00000439720 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.71□□□□□ -1.66
RABGEF1-203ENST00000439720 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1-203ENST00000439720 PKD1P98161 4303 aa4.7□□□□□ -1.66
RABGEF1-203ENST00000439720 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-203ENST00000439720 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-203ENST00000439720 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-203ENST00000439720 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.69□□□□□ -1.66
RABGEF1-203ENST00000439720 A0A1B0GU33 70 aa4.66□□□□□ -1.66
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