RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375425.9

NELFE-201, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-201ENST00000375425 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.15□□□□□ -1.27
NELFE-201ENST00000375425 FAM236CP0DP71 79 aa7.15□□□□□ -1.27
NELFE-201ENST00000375425 VPS25Q9BRG1 176 aa7.15□□□□□ -1.27
NELFE-201ENST00000375425 C9orf118A6NHY6 69 aa7.14□□□□□ -1.27
NELFE-201ENST00000375425 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
NELFE-201ENST00000375425 HRES1P13985 223 aa7.12□□□□□ -1.27
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NELFE-201ENST00000375425 DSCR8Q96T75 97 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-201ENST00000375425 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.12□□□□□ -1.27
NELFE-201ENST00000375425 A0A1B0GVX0 72 aa7.11□□□□□ -1.27
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NELFE-201ENST00000375425 C9JAW5 83 aa7.08□□□□□ -1.28
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NELFE-201ENST00000375425 K7EP34 96 aa7.05□□□□□ -1.28
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NELFE-201ENST00000375425 SPCS1Q9Y6A9 102 aa7.02□□□□□ -1.29
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NELFE-201ENST00000375425 SPINK7P58062 85 aa7.01□□□□□ -1.29
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NELFE-201ENST00000375425 KRTAP10-10P60014 251 aa7□□□□□ -1.29
NELFE-201ENST00000375425 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
NELFE-201ENST00000375425 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-201ENST00000375425 ATXN8Q156A1 80 aa6.99□□□□□ -1.29
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NELFE-201ENST00000375425 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.97□□□□□ -1.29
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NELFE-201ENST00000375425 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.96□□□□□ -1.3
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NELFE-201ENST00000375425 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.92□□□□□ -1.3
NELFE-201ENST00000375425 F8W1H4 67 aa6.92□□□□□ -1.3
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NELFE-201ENST00000375425 J3QR89 54 aa6.91□□□□□ -1.3
NELFE-201ENST00000375425 Q6ZVQ6 151 aa6.91□□□□□ -1.3
NELFE-201ENST00000375425 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.9□□□□□ -1.31
NELFE-201ENST00000375425 PRR15Q8IV56 129 aa6.9□□□□□ -1.31
NELFE-201ENST00000375425 PCP4P48539 62 aa6.89□□□□□ -1.31
NELFE-201ENST00000375425 NREPQ16612 68 aa6.89□□□□□ -1.31
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.89□□□□□ -1.31
NELFE-201ENST00000375425 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
NELFE-201ENST00000375425 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
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NELFE-201ENST00000375425 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.83□□□□□ -1.32
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NELFE-201ENST00000375425 K7EQZ3 153 aa6.8□□□□□ -1.32
NELFE-201ENST00000375425 NDUFS5O43920 106 aa6.8□□□□□ -1.32
NELFE-201ENST00000375425 H3BT86 120 aa6.78□□□□□ -1.32
NELFE-201ENST00000375425 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFE-201ENST00000375425 BPY2O14599 106 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-201ENST00000375425 LINC00846Q9NV44 126 aa6.74□□□□□ -1.33
NELFE-201ENST00000375425 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-201ENST00000375425 IGKV2-30P06310 120 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-201ENST00000375425 SCGB1A1P11684 91 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-201ENST00000375425 Q5W150 140 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-201ENST00000375425 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-201ENST00000375425 Q8N9L7 120 aa6.69□□□□□ -1.34
NELFE-201ENST00000375425 CASC2Q6XLA1 102 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-201ENST00000375425 HCG22E2RYF7 251 aa6.67□□□□□ -1.34
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NELFE-201ENST00000375425 C4orf26Q17RF5 130 aa6.63□□□□□ -1.35
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NELFE-201ENST00000375425 CXCL6P80162 114 aa6.6□□□□□ -1.35
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NELFE-201ENST00000375425 LINC00643Q86TS7 51 aa6.47□□□□□ -1.37
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NELFE-201ENST00000375425 ANAPC13Q9BS18 74 aa6.42□□□□□ -1.38
NELFE-201ENST00000375425 NEBP20929 6669 aa6.41□□□□□ -1.38
NELFE-201ENST00000375425 MT1BP07438 61 aa6.41□□□□□ -1.38
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