RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 SACSQ9NZJ4 4579 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00208Q96KT6 92 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 PKHD1P08F94 4074 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 BRK1Q8WUW1 75 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GVX0 72 aa2.56□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 C7orf65Q6ZTY9 151 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00643Q86TS7 51 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.55□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 Q5XG85 94 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 A8MWP4 228 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa2.54□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 K7EQZ3 153 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP10-8P60410 259 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZQT0 140 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 SERP2Q8N6R1 65 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 PMAIP1Q13794 54 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 LINC01554Q52M75 96 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 SPTSSBQ8NFR3 76 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.53□□□□□ -2
PTPRC-201ENST00000348564 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.53□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PNM2 257 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 RYR2Q92736 4967 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00846Q9NV44 126 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 SPRR1BP22528 89 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 SPINK7P58062 85 aa2.52□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 H0Y9P7 68 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 NDUFC1O43677 76 aa2.51□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 CXCL6P80162 114 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00483Q53H64 154 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1B0GW54 56 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 PRR15Q8IV56 129 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH5Q8TE73 4624 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa2.5□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 TPRXLQ17RH7 258 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 LRP1BQ9NZR2 4599 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 CSAG1Q6PB30 78 aa2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM254Q8TBM7 123 aa2.48□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 C20orf197Q8N268 126 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 PKD1P98161 4303 aa2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 RYR3Q15413 4870 aa2.46□□□□□ -2.01
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 XP32Q5T750 250 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 A0A087WVE0 104 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 CYSTM1Q9H1C7 97 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.46□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 MT1HL1P0DM35 61 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 MPLKIPQ8TAP9 179 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 KIAA1109Q2LD37 5005 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 FAT1Q14517 4588 aa2.45□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 K7ERS5 55 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 LCE2BO14633 110 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP10-10P60014 251 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 SNURFQ9Y675 71 aa2.44□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.43□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 APOBP04114 4563 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 TNXBP22105 4242 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 Q75L30 129 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 FAT3Q8TDW7 4589 aa2.42□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 H7BZZ5 65 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 S4R3F8 94 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 RYR1P21817 5038 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 H3BS24 57 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 ACYP2P14621 99 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.41□□□□□ -2.02
PTPRC-201ENST00000348564 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 KLKP1Q107X0 134 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 LCA10Q71F78 164 aa2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP2.4□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 R4GN34 69 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 BIRC6Q9NR09 4857 aa2.39□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 PLAC4Q8WY50 150 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 HSPG2P98160 4391 aa2.38□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 PRR15LQ9BU68 103 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.37□□□□□ -2.03
PTPRC-201ENST00000348564 SPINT4Q6UDR6 99 aa2.36□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 6.9 ms