RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.15□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 LCA10Q71F78 164 aa6.15□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 MYO18BQ8IUG5 2567 aa6.15□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 A6NN06 94 aa6.15□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 H0Y9J4 135 aa6.15□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.15□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 ABCA12Q86UK0 2595 aa6.15□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.14□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.14□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 COA5Q86WW8 74 aa6.14□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 SONP18583 2426 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 PRR15LQ9BU68 103 aa6.13□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa6.13□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.13□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 SMR3AQ99954 134 aa6.12□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 LYSTQ99698 3801 aa6.12□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.12□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 ZNF462Q96JM2 2506 aa6.12□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.12□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP10-11P60412 298 aa6.11□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZR54 194 aa6.11□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 ACACBO00763 2458 aa6.11□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 NDUFS5O43920 106 aa6.1□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 PRLHP81277 87 aa6.09□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 USP24Q9UPU5 2620 aa6.09□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.09□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 Q96NJ1 140 aa6.09□□□□□ -1.43
HCG18-242ENST00000602319 C11orf45Q8TAV5 145 aa6.08□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 HIVEP2P31629 2446 aa6.08□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 A0A096LNI7 61 aa6.08□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 FAM208BQ5VWN6 2430 aa6.07□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.07□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.07□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.07□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.06□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 CCDC168Q8NDH2 2452 aa6.06□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 MOBPQ13875 183 aa6.06□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.05□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 TENM4Q6N022 2769 aa6.05□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 TENM2Q9NT68 2774 aa6.04□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 A6NED7 52 aa6.04□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.03□□□□□ -1.44
HCG18-242ENST00000602319 INAFM1C9JVW0 142 aa6.02□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.02□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP6.02□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.02□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.01□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.01□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 HRES1P13985 223 aa6□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.99□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 CHTF8P0CG12 524 aa5.99□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 LINC00483Q53H64 154 aa5.99□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.98□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.98□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 SPINK7P58062 85 aa5.97□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.97□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 PCOTHQ58A44 107 aa5.97□□□□□ -1.45
HCG18-242ENST00000602319 A0A1B0GVX0 72 aa5.96□□□□□ -1.46
HCG18-242ENST00000602319 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.96□□□□□ -1.46
HCG18-242ENST00000602319 ACANP16112 2415 aa5.96□□□□□ -1.46
HCG18-242ENST00000602319 MTORP42345 2549 aa5.95□□□□□ -1.46
HCG18-242ENST00000602319 TENM3Q9P273 2699 aa5.95□□□□□ -1.46
HCG18-242ENST00000602319 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.93□□□□□ -1.46
HCG18-242ENST00000602319 C14orf177Q52M58 125 aa5.93□□□□□ -1.46
HCG18-242ENST00000602319 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.92□□□□□ -1.46
HCG18-242ENST00000602319 A0A087X002 238 aa5.92□□□□□ -1.46
HCG18-242ENST00000602319 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.91□□□□□ -1.46
HCG18-242ENST00000602319 ITPR2Q14571 2701 aa5.9□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 J3QKU1 62 aa5.89□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 NOTCH2Q04721 2471 aa5.89□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa5.88□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.88□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa5.87□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.86□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.86□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 MDFIQ99750 246 aa5.86□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa5.86□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 PANO1I0J062 215 aa5.86□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 DMAC1Q96GE9 116 aa5.86□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 SPACA4Q8TDM5 124 aa5.85□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 Q5W150 140 aa5.85□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
HCG18-242ENST00000602319 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa5.84□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 LINC00313P59037 77 aa5.84□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 PRR26Q8N8Z3 221 aa5.84□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
HCG18-242ENST00000602319 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.83□□□□□ -1.48
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