RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590509.5

PTPRS-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type S, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRS, Length 893 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRS-208ENST00000590509 HIST1H2BMQ99879 126 aa8□□□□□ -1.13
PTPRS-208ENST00000590509 HERVK_113P61574 105 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRS-208ENST00000590509 CBY1Q9Y3M2 126 aa7.99□□□□□ -1.13
PTPRS-208ENST00000590509 IGKCP01834 107 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRS-208ENST00000590509 LEPROTL1O95214 131 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRS-208ENST00000590509 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 E9PLD3 99 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 Q96NJ1 140 aa7.96□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 TRGC2P03986 189 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 FABP4P15090 132 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 HIST1H2BLQ99880 126 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 TTTY13Q9BZ97 58 aa7.95□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 SERF1AO75920 110 aa7.94□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.92□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1B0GWB2 263 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 A8MUU9 505 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 IGFL1Q6UW32 110 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 TIMM17BO60830 172 aa7.9□□□□□ -1.14
PTPRS-208ENST00000590509 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.87□□□□□ -1.15
PTPRS-208ENST00000590509 M0R143 59 aa7.86□□□□□ -1.15
PTPRS-208ENST00000590509 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRS-208ENST00000590509 FAM236CP0DP71 79 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRS-208ENST00000590509 HRES1P13985 223 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRS-208ENST00000590509 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRS-208ENST00000590509 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRS-208ENST00000590509 ZNF815PA8K554 130 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRS-208ENST00000590509 CLEC2BQ92478 149 aa7.84□□□□□ -1.15
PTPRS-208ENST00000590509 A6NDN8 102 aa7.83□□□□□ -1.16
PTPRS-208ENST00000590509 DLEU1O43261 78 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRS-208ENST00000590509 SMIM11BQ8TCY0 68 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRS-208ENST00000590509 F8WEM9 126 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRS-208ENST00000590509 LINC00846Q9NV44 126 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRS-208ENST00000590509 LST1O00453 97 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRS-208ENST00000590509 DSCR10P59022 87 aa7.79□□□□□ -1.16
PTPRS-208ENST00000590509 ANKRD39Q53RE8 183 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRS-208ENST00000590509 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRS-208ENST00000590509 Q6JHZ5 121 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRS-208ENST00000590509 Q6ZQY7 126 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRS-208ENST00000590509 A4D1N5 150 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 NEBP20929 6669 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 H3BUT2 72 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 LINC00575Q6W349 94 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 MUSTN1Q8IVN3 82 aa7.76□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 SCGB1D1O95968 90 aa7.75□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 LINC01545Q5VT33 79 aa7.73□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 MUC12Q9UKN1 5478 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa7.72□□□□□ -1.17
PTPRS-208ENST00000590509 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.71□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.7□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 VAMP8Q9BV40 100 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 hADV29S1A0JD25 119 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 PCP4P48539 62 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 SCGB1D4Q6XE38 83 aa7.69□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 IFITM1P13164 125 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 PAM16Q9Y3D7 125 aa7.65□□□□□ -1.18
PTPRS-208ENST00000590509 A0A087WSZ3 146 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 PET117Q6UWS5 81 aa7.63□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 C3orf79P0CE67 100 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 SPATA45Q537H7 98 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 BATFQ16520 125 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 UBE2V1Q13404 147 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 VAMP3Q15836 100 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.6□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 Q6ZVH6 145 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 LINC00313P59037 77 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 KRTDAPP60985 99 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRS-208ENST00000590509 ATOH7Q8N100 152 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRS-208ENST00000590509 COPS9Q8WXC6 57 aa7.58□□□□□ -1.2
PTPRS-208ENST00000590509 TEN1Q86WV5 123 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRS-208ENST00000590509 SIGMAR1Q99720 223 aa7.57□□□□□ -1.2
PTPRS-208ENST00000590509 A8MWP4 228 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRS-208ENST00000590509 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRS-208ENST00000590509 A0A1W2PNM2 257 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRS-208ENST00000590509 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.52□□□□□ -1.21
PTPRS-208ENST00000590509 IGKV4-1P06312 121 aa7.5□□□□□ -1.21
PTPRS-208ENST00000590509 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
PTPRS-208ENST00000590509 TAX1BP3O14907 124 aa7.49□□□□□ -1.21
PTPRS-208ENST00000590509 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.48□□□□□ -1.21
PTPRS-208ENST00000590509 SPINK7P58062 85 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRS-208ENST00000590509 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRS-208ENST00000590509 MTURNQ8N3F0 131 aa7.47□□□□□ -1.21
PTPRS-208ENST00000590509 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRS-208ENST00000590509 K7ERU9 68 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRS-208ENST00000590509 H3BMG7 143 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRS-208ENST00000590509 VPS25Q9BRG1 176 aa7.43□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.7 ms