RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580713.1

TOP3A-210, Transcript of DNA topoisomerase III alpha, humanhuman

TSL 2

Gene TOP3A, Length 474 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3A-210ENST00000580713 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.36□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 C6orf99Q4VX62 202 aa6.36□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.36□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 A0A1W2PPM0 123 aa6.35□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 VAMP3Q15836 100 aa6.35□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.35□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 SVIPQ8NHG7 77 aa6.35□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 FABP2P12104 132 aa6.34□□□□□ -1.39
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.33□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.33□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 H0YGX0 51 aa6.33□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 SPRR1AP35321 89 aa6.33□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 COX7BP24311 80 aa6.32□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 CLEC2BQ92478 149 aa6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.31□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 A0A1B0GV90 55 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 TCL1BO95988 128 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.3□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 LST1O00453 97 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 BCE1O60756 84 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 ATXN8Q156A1 80 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZRX8 168 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.29□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 K7EP34 96 aa6.28□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 SLC25A20O43772 301 aa6.28□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 SNCGO76070 127 aa6.28□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00575Q6W349 94 aa6.28□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.28□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 MUC17Q685J3 4493 aa6.28□□□□□ -1.4
TOP3A-210ENST00000580713 A0A1B0GX51 115 aa6.27□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 UBE2AP49459 152 aa6.27□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 PRLHP81277 87 aa6.27□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 hADV29S1A0JD25 119 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF861PO60384 105 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 TRACP01848 142 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 TPRXLQ17RH7 258 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 Q9BRP9 147 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.26□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 A0A087X002 238 aa6.25□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 H3BMG7 143 aa6.25□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 DNAL4O96015 105 aa6.25□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 CRYGAP11844 174 aa6.25□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.24□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 SMCR5Q8TEV8 140 aa6.24□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.24□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 C9JAW5 83 aa6.22□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 UBE2V1Q13404 147 aa6.22□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TOP3A-210ENST00000580713 ERC2-IT1O76042 136 aa6.21□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 Q6ZQY7 126 aa6.21□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.21□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.2□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 MTURNQ8N3F0 131 aa6.2□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.2□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.2□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.19□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 H3BQ85 93 aa6.18□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 H3BT86 120 aa6.18□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.18□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 PRO0461Q9UI25 63 aa6.18□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 F8W1H4 67 aa6.17□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.17□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.17□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.16□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.16□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.16□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.16□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.15□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.15□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 Q8N377 158 aa6.15□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 SPRR4Q96PI1 79 aa6.15□□□□□ -1.42
TOP3A-210ENST00000580713 SPRR1BP22528 89 aa6.13□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.13□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.13□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.12□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.11□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 LINC00483Q53H64 154 aa6.11□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.11□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 SMIM29Q86T20 159 aa6.1□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 A0A1B0GV72 72 aa6.09□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 F8WEM9 126 aa6.09□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.09□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 ETDBQ3ZM63 59 aa6.09□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 TEN1Q86WV5 123 aa6.09□□□□□ -1.43
TOP3A-210ENST00000580713 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
TOP3A-210ENST00000580713 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
TOP3A-210ENST00000580713 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.07□□□□□ -1.44
TOP3A-210ENST00000580713 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.06□□□□□ -1.44
TOP3A-210ENST00000580713 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.05□□□□□ -1.44
TOP3A-210ENST00000580713 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.05□□□□□ -1.44
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