RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549221.5

CS-216, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-216ENST00000549221 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.87□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 GAGE2AQ6NT46 116 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.86□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 SPRR1BP22528 89 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 LINC00483Q53H64 154 aa4.85□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 A0A087X002 238 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 C9JAW5 83 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 DNAL4O96015 105 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 SMIM29Q86T20 159 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 PRO0461Q9UI25 63 aa4.84□□□□□ -1.63
CS-216ENST00000549221 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.84□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.83□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.82□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 SNCGO76070 127 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 PRR26Q8N8Z3 221 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.81□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 TNXBP22105 4242 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 A0A0G2JQZ4 141 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 A0A1B0GV72 72 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.8□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 H3BT86 120 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 PCP4P48539 62 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.79□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 UBE2V1Q13404 147 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 MOBPQ13875 183 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.79□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 CRYGAP11844 174 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 LINC01600Q96MT4 127 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.78□□□□□ -1.64
CS-216ENST00000549221 MT1HL1P0DM35 61 aa4.77□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.77□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 H3BQ85 93 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 KRTAP10-8P60410 259 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa4.76□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 F8W1H4 67 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 GHRHP01286 108 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 IGFL1Q6UW32 110 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 Q8NBF4 154 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 MUC2Q02817 5179 aa4.75□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 F8WEM9 126 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.74□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 ETDBQ3ZM63 59 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.73□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 A0A1W2PNM2 257 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 OXTP01178 125 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.72□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 TEN1Q86WV5 123 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-216ENST00000549221 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 Q6JHZ5 121 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 HRCT1Q6UXD1 115 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 Q6ZQT0 140 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 LCE2CQ5TA81 110 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 DSCR8Q96T75 97 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 CCKP06307 115 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 Q6Q795 121 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 VPS25Q9BRG1 176 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 LRP2P98164 4655 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 CD164Q04900 197 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-216ENST00000549221 A0A087WSZ3 146 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 SPINK1P00995 79 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 PDE6GP18545 87 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 SPAG11AQ6PDA7 123 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 RPS29P62273 56 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 Q5XG85 94 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 Q96NJ1 140 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 LINC00846Q9NV44 126 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 C1orf195Q5TG92 126 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 DEFB116Q30KQ4 102 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 LIMD2Q9BT23 127 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-216ENST00000549221 Q6ZVQ6 151 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-216ENST00000549221 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-216ENST00000549221 SS18L2Q9UHA2 77 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-216ENST00000549221 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-216ENST00000549221 A0A1B0GW54 56 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-216ENST00000549221 NREPQ16612 68 aa4.55□□□□□ -1.68
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