RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548567.5

CS-212, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CS, Length 3,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-212ENST00000548567 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa4.72□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 CCKP06307 115 aa4.71□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.71□□□□□ -1.65
CS-212ENST00000548567 H7BZZ5 65 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 C20orf197Q8N268 126 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 C6orf48Q9UBA6 75 aa4.71□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.7□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 SEC61GP60059 68 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 PRR4Q16378 134 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP4.7□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 PKIGQ9Y2B9 76 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 V9GYY9 64 aa4.7□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 KLKP1Q107X0 134 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 C1orf195Q5TG92 126 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa4.69□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 PRLHP81277 87 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 SMIM11BQ8TCY0 68 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 Q6ZSA8 131 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 SPACA4Q8TDM5 124 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.68□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 NCR3O14931 201 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 NDUFC1O43677 76 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 LINC00167Q96N53 147 aa4.67□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 LINC00158P58513 81 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 SND1-IT1Q9HBX3 110 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 UBL5Q9BZL1 73 aa4.66□□□□□ -1.66
CS-212ENST00000548567 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.65□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.64□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 F8WEM9 126 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 BRK1Q8WUW1 75 aa4.64□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 CNBPP62633 177 aaKnown RBP4.63□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 UBE2AP49459 152 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.62□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 NKAPP1Q8N9T2 125 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 COX7B2Q8TF08 81 aa4.62□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 LINC00474Q9P2X8 69 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 KIAA0087Q14695 138 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 A0A0U1RQV1 116 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 SNURFQ9Y675 71 aa4.61□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 ERC2-IT1O76042 136 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 PLAC8Q9NZF1 115 aa4.6□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 CXCL6P80162 114 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 MT1HL1P0DM35 61 aa4.59□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
CS-212ENST00000548567 Q6ZQT0 140 aa4.59□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 Q8NDZ9 215 aa4.58□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 A0A087X002 238 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 Q6ZVQ6 151 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 A0A0G2JQZ4 141 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 PDE6GP18545 87 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 PRR15Q8IV56 129 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 IGLV7-43P04211 117 aa4.57□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 H3BQ85 93 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 NREPQ16612 68 aa4.56□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 PMAIP1Q13794 54 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 FAM229BQ4G0N7 80 aa4.55□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 REG3GQ6UW15 175 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 PRYO14603 147 aa4.54□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 LINC00575Q6W349 94 aa4.53□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 DIRC1Q969H9 104 aa4.53□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.53□□□□□ -1.68
CS-212ENST00000548567 BPY2O14599 106 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 Q8IZM0 81 aa4.51□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 CD164Q04900 197 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 Q1T7F1 81 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 C6orf99Q4VX62 202 aa4.5□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 hDV103S1A0JD37 113 aa4.49□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 OCR1Q9BZK8 76 aa4.49□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 H0Y9J4 135 aa4.49□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 ZNF861PO60384 105 aa4.49□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 COX17Q14061 63 aa4.49□□□□□ -1.69
CS-212ENST00000548567 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.48□□□□□ -1.69
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