RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544999.2

HOXD8-204, Transcript of homeobox D8, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,235 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-204ENST00000544999 DLEU1O43261 78 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXD8-204ENST00000544999 HIST1H4GQ99525 98 aa9.39□□□□□ -0.91
HOXD8-204ENST00000544999 H7C2G1 150 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXD8-204ENST00000544999 LINC00575Q6W349 94 aa9.38□□□□□ -0.91
HOXD8-204ENST00000544999 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.37□□□□□ -0.91
HOXD8-204ENST00000544999 hADV29S1A0JD25 119 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXD8-204ENST00000544999 Q5XG85 94 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXD8-204ENST00000544999 C12orf57Q99622 126 aa9.35□□□□□ -0.91
HOXD8-204ENST00000544999 Q6ZQY7 126 aa9.33□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 F8WEM9 126 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 SPATA45Q537H7 98 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 C14orf144Q96I85 54 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 HIGD1BQ9P298 99 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 PAM16Q9Y3D7 125 aa9.32□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 A0A0G2JQZ4 141 aa9.31□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 VAMP8Q9BV40 100 aa9.3□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 CFC1BP0CG36 223 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 CFC1P0CG37 223 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 FAT4Q6V0I7 4981 aa9.29□□□□□ -0.92
HOXD8-204ENST00000544999 C1orf195Q5TG92 126 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 RAB37Q96AX2 223 aa9.27□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 A0A0B4J2C4 111 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 Q6JHZ5 121 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.26□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 C9orf92A6NGG3 77 aa9.25□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 TCL1BO95988 128 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa9.24□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 OCIAD2Q56VL3 154 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 CLEC2BQ92478 149 aa9.23□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 IGFL1Q6UW32 110 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 CEND1Q8N111 149 aa9.22□□□□□ -0.93
HOXD8-204ENST00000544999 H0YGX0 51 aa9.21□□□□□ -0.94
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXD8-204ENST00000544999 SNCGO76070 127 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXD8-204ENST00000544999 SNHG12Q9BXW3 62 aa9.2□□□□□ -0.94
HOXD8-204ENST00000544999 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa9.19□□□□□ -0.94
HOXD8-204ENST00000544999 PRO1854Q9UHT4 67 aa9.17□□□□□ -0.94
HOXD8-204ENST00000544999 FXYD2P54710 66 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXD8-204ENST00000544999 PCOTHQ58A44 107 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXD8-204ENST00000544999 PYY3Q5JQD4 70 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXD8-204ENST00000544999 FAM218AQ96MZ4 157 aa9.16□□□□□ -0.94
HOXD8-204ENST00000544999 A0A1B0GX51 115 aa9.15□□□□□ -0.94
HOXD8-204ENST00000544999 H3BUT2 72 aa9.13□□□□□ -0.95
HOXD8-204ENST00000544999 HSD52Q0P140 79 aa9.11□□□□□ -0.95
HOXD8-204ENST00000544999 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
HOXD8-204ENST00000544999 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
HOXD8-204ENST00000544999 Q6Q795 121 aa9.1□□□□□ -0.95
HOXD8-204ENST00000544999 TRIAP1O43715 76 aa9.09□□□□□ -0.95
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa9.07□□□□□ -0.96
HOXD8-204ENST00000544999 LST1O00453 97 aa9.07□□□□□ -0.96
HOXD8-204ENST00000544999 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP9.07□□□□□ -0.96
HOXD8-204ENST00000544999 TEN1Q86WV5 123 aa9.06□□□□□ -0.96
HOXD8-204ENST00000544999 FABP2P12104 132 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXD8-204ENST00000544999 UQCR10Q9UDW1 63 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXD8-204ENST00000544999 SS18L2Q9UHA2 77 aa9.05□□□□□ -0.96
HOXD8-204ENST00000544999 H3BMG7 143 aa9.04□□□□□ -0.96
HOXD8-204ENST00000544999 K7ERJ3 54 aa9.02□□□□□ -0.97
HOXD8-204ENST00000544999 PSMB2P49721 201 aa9.02□□□□□ -0.97
HOXD8-204ENST00000544999 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa9.02□□□□□ -0.97
HOXD8-204ENST00000544999 DNAL4O96015 105 aa9.01□□□□□ -0.97
HOXD8-204ENST00000544999 COX6CP09669 75 aa9.01□□□□□ -0.97
HOXD8-204ENST00000544999 H3BQ85 93 aa9□□□□□ -0.97
HOXD8-204ENST00000544999 ORMDL1Q9P0S3 153 aa9□□□□□ -0.97
HOXD8-204ENST00000544999 A0A087WSZ3 146 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXD8-204ENST00000544999 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.99□□□□□ -0.97
HOXD8-204ENST00000544999 Q75L30 129 aa8.97□□□□□ -0.97
HOXD8-204ENST00000544999 A0A1W2PNM2 257 aa8.96□□□□□ -0.98
HOXD8-204ENST00000544999 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.95□□□□□ -0.98
HOXD8-204ENST00000544999 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.94□□□□□ -0.98
HOXD8-204ENST00000544999 Q96NJ1 140 aa8.94□□□□□ -0.98
HOXD8-204ENST00000544999 MT1HP80294 61 aa8.92□□□□□ -0.98
HOXD8-204ENST00000544999 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.92□□□□□ -0.98
HOXD8-204ENST00000544999 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.91□□□□□ -0.98
HOXD8-204ENST00000544999 TRACP01848 142 aa8.9□□□□□ -0.98
HOXD8-204ENST00000544999 UBE2V1Q13404 147 aa8.9□□□□□ -0.98
HOXD8-204ENST00000544999 A0A1B0GV72 72 aa8.89□□□□□ -0.99
HOXD8-204ENST00000544999 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.89□□□□□ -0.99
HOXD8-204ENST00000544999 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.88□□□□□ -0.99
HOXD8-204ENST00000544999 SIGMAR1Q99720 223 aa8.86□□□□□ -0.99
HOXD8-204ENST00000544999 A8MUU9 505 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXD8-204ENST00000544999 CCKP06307 115 aa8.85□□□□□ -0.99
HOXD8-204ENST00000544999 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.84□□□□□ -0.99
HOXD8-204ENST00000544999 IGKV4-1P06312 121 aa8.83□□□□□ -1
HOXD8-204ENST00000544999 DSCR10P59022 87 aa8.83□□□□□ -1
HOXD8-204ENST00000544999 M0R143 59 aa8.82□□□□□ -1
HOXD8-204ENST00000544999 LCE1DQ5T752 114 aa8.82□□□□□ -1
HOXD8-204ENST00000544999 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.81□□□□□ -1
HOXD8-204ENST00000544999 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.8□□□□□ -1
HOXD8-204ENST00000544999 LINC00313P59037 77 aa8.79□□□□□ -1
HOXD8-204ENST00000544999 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.78□□□□□ -1
HOXD8-204ENST00000544999 SMIM6P0DI80 62 aa8.78□□□□□ -1
HOXD8-204ENST00000544999 DSCR8Q96T75 97 aa8.78□□□□□ -1
HOXD8-204ENST00000544999 VPS25Q9BRG1 176 aa8.77□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms