RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000542443.5

TRDN-204, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,294 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-204ENST00000542443 TRGV2A0A075B6R0 118 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 IGLV1-51P01701 117 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 HAMPP81172 84 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 FAM229BQ4G0N7 80 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 C1orf195Q5TG92 126 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 Q6ZQY7 126 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 DIRC1Q969H9 104 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 SNURFQ9Y675 71 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.05□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 PRR3P79522 188 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 DEFB136Q30KP8 78 aa3.04□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 PRO0255Q9UI72 69 aa3.04□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP3.04□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 HIVEP1P15822 2718 aa3.03□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 LYRM9A8MSI8 78 aa3.03□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP3.03□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 SPRR4Q96PI1 79 aa3.03□□□□□ -1.92
TRDN-204ENST00000542443 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 SPAG11BQ08648 103 aa3.02□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 WFDC11Q8NEX6 87 aa3.02□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 WNK1Q9H4A3 2382 aa3.02□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 M0R378 163 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 LINC00269Q8N2A0 174 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 C6orf48Q9UBA6 75 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 PKIGQ9Y2B9 76 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 CCDC168Q8NDH2 2452 aa3.01□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 DAD1P61803 113 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 LELP1Q5T871 98 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 BRK1Q8WUW1 75 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 KCNQ1DNQ9H478 68 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 SPG11Q96JI7 2443 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 F8P00451 2351 aa3□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa2.99□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 H3BPC8 53 aa2.99□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 SPRR1AP35321 89 aa2.99□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 PMAIP1Q13794 54 aa2.99□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.99□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 HIGD2AQ9BW72 106 aa2.99□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 A0A1W2PNM2 257 aa2.98□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 NDUFB1O75438 58 aa2.98□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 TLX1NBP0CAT3 122 aa2.98□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 SCXQ7RTU7 201 aa2.98□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 Q9BRP9 147 aa2.98□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.98□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 STAB1Q9NY15 2570 aa2.98□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.97□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 H3BNG1 76 aa2.97□□□□□ -1.93
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TRDN-204ENST00000542443 UBE2AP49459 152 aa2.97□□□□□ -1.93
TRDN-204ENST00000542443 CD164Q04900 197 aa2.97□□□□□ -1.93
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TRDN-204ENST00000542443 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.96□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.96□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 DEFB116Q30KQ4 102 aa2.96□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 Q5VV11 94 aa2.96□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 WFDC10AQ9H1F0 79 aa2.96□□□□□ -1.94
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TRDN-204ENST00000542443 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 CLPSL2Q6UWE3 100 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 C15orf56Q8N910 161 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 Q8NAQ8 132 aa2.95□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 COL6A5A8TX70 2615 aa2.94□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa2.94□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 A0A096LPF7 62 aa2.94□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 HCG22E2RYF7 251 aa2.94□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 DEFB130BP0DP73 79 aa2.94□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 DEFB130AP0DP74 79 aa2.94□□□□□ -1.94
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TRDN-204ENST00000542443 DEFB113Q30KQ7 82 aa2.94□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 Q6ZRX8 168 aa2.94□□□□□ -1.94
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TRDN-204ENST00000542443 LIMD2Q9BT23 127 aa2.94□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 PLAC8Q9NZF1 115 aa2.94□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP2.94□□□□□ -1.94
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TRDN-204ENST00000542443 UBE2BP63146 152 aa2.93□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 C1orf137Q5JT78 98 aa2.93□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 C9orf163Q8N9P6 203 aa2.93□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.93□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 JMJD1CQ15652 2540 aa2.92□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa2.92□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa2.92□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa2.92□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa2.92□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.92□□□□□ -1.94
TRDN-204ENST00000542443 B9D2Q9BPU9 175 aa2.92□□□□□ -1.94
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