RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493582.5

HDAC4-210, Transcript of histone deacetylase 4, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HDAC4, Length 3,188 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4-210ENST00000493582 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.44□□□□□ -1.22
HDAC4-210ENST00000493582 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
HDAC4-210ENST00000493582 TENM4Q6N022 2769 aa7.43□□□□□ -1.22
HDAC4-210ENST00000493582 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.43□□□□□ -1.22
HDAC4-210ENST00000493582 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa7.42□□□□□ -1.22
HDAC4-210ENST00000493582 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
HDAC4-210ENST00000493582 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
HDAC4-210ENST00000493582 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC4-210ENST00000493582 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
HDAC4-210ENST00000493582 CASC2Q6XLA1 102 aa7.41□□□□□ -1.22
HDAC4-210ENST00000493582 KRTAP1-1Q07627 177 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 Q75L30 129 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 COA5Q86WW8 74 aa7.39□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 A6NN06 94 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 C9orf163Q8N9P6 203 aa7.38□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.37□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 ATRQ13535 2644 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 CASC10Q5T4H9 136 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 PRLHP81277 87 aa7.36□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 REG3GQ6UW15 175 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.35□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 H3BPC8 53 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 PCOTHQ58A44 107 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 TENM3Q9P273 2699 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 NDUFS5O43920 106 aa7.34□□□□□ -1.23
HDAC4-210ENST00000493582 LINC01556Q5JQF7 62 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.33□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 CSMD3Q7Z407 3707 aa7.32□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 MOBPQ13875 183 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 SMR3AQ99954 134 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 H3BNG1 76 aa7.31□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 A8MWP4 228 aa7.3□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 H0Y9J4 135 aa7.29□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 A0A096LNI7 61 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 SPINK7P58062 85 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 C7orf65Q6ZTY9 151 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.28□□□□□ -1.24
HDAC4-210ENST00000493582 J3QKU1 62 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC4-210ENST00000493582 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.26□□□□□ -1.25
HDAC4-210ENST00000493582 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa7.25□□□□□ -1.25
HDAC4-210ENST00000493582 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC4-210ENST00000493582 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC4-210ENST00000493582 C11orf45Q8TAV5 145 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC4-210ENST00000493582 TENM2Q9NT68 2774 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC4-210ENST00000493582 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.24□□□□□ -1.25
HDAC4-210ENST00000493582 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.23□□□□□ -1.25
HDAC4-210ENST00000493582 ANK2Q01484 3957 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC4-210ENST00000493582 H3BS24 57 aa7.21□□□□□ -1.26
HDAC4-210ENST00000493582 HRES1P13985 223 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC4-210ENST00000493582 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa7.2□□□□□ -1.26
HDAC4-210ENST00000493582 COL7A1Q02388 2944 aa7.19□□□□□ -1.26
HDAC4-210ENST00000493582 PRAC1Q96KF2 57 aa7.18□□□□□ -1.26
HDAC4-210ENST00000493582 C8orf87E5RJ46 101 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC4-210ENST00000493582 MAST4O15021 2626 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC4-210ENST00000493582 LINC00313P59037 77 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC4-210ENST00000493582 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.16□□□□□ -1.26
HDAC4-210ENST00000493582 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa7.14□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 Q6ZR54 194 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 CHTF8P0CG12 524 aa7.13□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 KRTAP10-11P60412 298 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 SPRR1BP22528 89 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 Q96NJ1 140 aa7.12□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.11□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 NOTCH1P46531 2555 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 COL6A5A8TX70 2615 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 K7EIL1 84 aa7.1□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 INAFM1C9JVW0 142 aa7.09□□□□□ -1.27
HDAC4-210ENST00000493582 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.09□□□□□ -1.27
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HDAC4-210ENST00000493582 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.07□□□□□ -1.28
HDAC4-210ENST00000493582 LYSTQ99698 3801 aa7.05□□□□□ -1.28
HDAC4-210ENST00000493582 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
HDAC4-210ENST00000493582 A0A1B0GVX0 72 aa7.04□□□□□ -1.28
HDAC4-210ENST00000493582 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC4-210ENST00000493582 STAB1Q9NY15 2570 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC4-210ENST00000493582 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.03□□□□□ -1.28
HDAC4-210ENST00000493582 Q5W150 140 aa7.02□□□□□ -1.29
HDAC4-210ENST00000493582 MDFIQ99750 246 aa7.02□□□□□ -1.29
HDAC4-210ENST00000493582 LINC01554Q52M75 96 aa7.01□□□□□ -1.29
HDAC4-210ENST00000493582 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.01□□□□□ -1.29
HDAC4-210ENST00000493582 CDK2AP2O75956 126 aa7□□□□□ -1.29
HDAC4-210ENST00000493582 ACYP2P14621 99 aa6.97□□□□□ -1.29
HDAC4-210ENST00000493582 PANO1I0J062 215 aa6.97□□□□□ -1.29
HDAC4-210ENST00000493582 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.96□□□□□ -1.29
HDAC4-210ENST00000493582 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.96□□□□□ -1.3
HDAC4-210ENST00000493582 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.96□□□□□ -1.3
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