RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 LINC00310P59036 64 aa7.06□□□□□ -1.28
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PRPF40A-211ENST00000493468 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.88□□□□□ -1.31
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PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.86□□□□□ -1.31
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PRPF40A-211ENST00000493468 C12orf57Q99622 126 aa6.72□□□□□ -1.33
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PRPF40A-211ENST00000493468 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.62□□□□□ -1.35
PRPF40A-211ENST00000493468 RAB37Q96AX2 223 aa6.61□□□□□ -1.35
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.61□□□□□ -1.35
PRPF40A-211ENST00000493468 KMT2DO14686 5537 aa6.61□□□□□ -1.35
PRPF40A-211ENST00000493468 H0YGX0 51 aa6.6□□□□□ -1.35
PRPF40A-211ENST00000493468 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.59□□□□□ -1.35
PRPF40A-211ENST00000493468 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PRPF40A-211ENST00000493468 LCE1DQ5T752 114 aa6.59□□□□□ -1.35
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1B0GVX0 72 aa6.58□□□□□ -1.36
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