RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493436.5

SH3BP4-211, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 481 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-211ENST00000493436 SPATA45Q537H7 98 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 C1orf195Q5TG92 126 aa9.16□□□□□ -0.94
SH3BP4-211ENST00000493436 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP9.14□□□□□ -0.95
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SH3BP4-211ENST00000493436 CFC1P0CG37 223 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 VAMP8Q9BV40 100 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 HIGD1BQ9P298 99 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 TCL1BO95988 128 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 RAB37Q96AX2 223 aa9.12□□□□□ -0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 Q6JHZ5 121 aa9.11□□□□□ -0.95
SH3BP4-211ENST00000493436 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.1□□□□□ -0.95
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SH3BP4-211ENST00000493436 C2orf91Q6ZV80 131 aa9.09□□□□□ -0.95
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SH3BP4-211ENST00000493436 CLEC2BQ92478 149 aa9.09□□□□□ -0.95
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SH3BP4-211ENST00000493436 CEND1Q8N111 149 aa9.05□□□□□ -0.96
SH3BP4-211ENST00000493436 H3BUT2 72 aa9.03□□□□□ -0.96
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SH3BP4-211ENST00000493436 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
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SH3BP4-211ENST00000493436 K7ERJ3 54 aa8.89□□□□□ -0.99
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SH3BP4-211ENST00000493436 ORMDL1Q9P0S3 153 aa8.85□□□□□ -0.99
SH3BP4-211ENST00000493436 Q75L30 129 aa8.84□□□□□ -0.99
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SH3BP4-211ENST00000493436 ANKRD29Q8N6D5 301 aa8.8□□□□□ -1
SH3BP4-211ENST00000493436 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa8.79□□□□□ -1
SH3BP4-211ENST00000493436 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.78□□□□□ -1
SH3BP4-211ENST00000493436 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa8.76□□□□□ -1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 SCGB1C2P0DMR2 95 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 SIGMAR1Q99720 223 aa8.75□□□□□ -1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 TRACP01848 142 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.74□□□□□ -1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 UBE2V1Q13404 147 aa8.73□□□□□ -1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 A8MUU9 505 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 CCKP06307 115 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 DSCR10P59022 87 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.72□□□□□ -1.01
SH3BP4-211ENST00000493436 IGKV4-1P06312 121 aa8.71□□□□□ -1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 M0R2T5 61 aa8.7□□□□□ -1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.69□□□□□ -1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00313P59037 77 aa8.68□□□□□ -1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.67□□□□□ -1.02
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SH3BP4-211ENST00000493436 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.66□□□□□ -1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 BAALC-AS2P0C853 105 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
SH3BP4-211ENST00000493436 M0R143 59 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 DSCR8Q96T75 97 aa8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.62□□□□□ -1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.6□□□□□ -1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 C9JAW5 83 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 ATXN8Q156A1 80 aa8.59□□□□□ -1.03
SH3BP4-211ENST00000493436 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 SMIM6P0DI80 62 aa8.58□□□□□ -1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.55□□□□□ -1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 A0A1B0GVX0 72 aa8.54□□□□□ -1.04
SH3BP4-211ENST00000493436 C8orf87E5RJ46 101 aa8.53□□□□□ -1.04
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