RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 IGIPA6NJ69 53 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00587B1AMM8 73 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 LEPROTL1O95214 131 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 MT2AP02795 61 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 ZNF56Q15929 161 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 MIAQ16674 131 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC01545Q5VT33 79 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 BAGE3Q86Y29 109 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 COPS9Q8WXC6 57 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 AMELXQ99217 191 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 C2orf88Q9BSF0 95 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 CYSLTR1Q9Y271 337 aa1.16□□□□□ -2.22
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A087WX48 190 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 MUC21A0A140T8X8 626 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 GRIFINA4D1Z8 144 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 C11orf86A6NJI1 115 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 F8VRH5 84 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2L6O14933 153 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 DLEU1O43261 78 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 NPYP01303 97 aa1.15□□□□□ -2.23
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RABGGTB-211ENST00000489450 IGLC3P0DOY3 106 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 HERVK_113P63121 156 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 S100A12P80511 92 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 COX17Q14061 63 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf137Q5JT78 98 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM74A4Q5TZK3 123 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST3H2BBQ8N257 126 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 OR5A1Q8NGJ0 315 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 IFI27L1Q96BM0 104 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H2BLQ99880 126 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa1.15□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 MUC5ACP98088 5654 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 HSBP1L1C9JCN9 74 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BRM9 83 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TIMM17BO60830 172 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 APOMO95445 188 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 MGPP08493 103 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 FGF6P10767 208 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 FABP4P15090 132 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 UBE2D1P51668 147 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 ARL17AQ8IVW1 177 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 Q8IZM0 81 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 SCGB3A1Q96QR1 104 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 PMCHL2Q9BQD1 86 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 CST9LQ9H4G1 147 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 HIGD1BQ9P298 99 aa1.14□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV30A0A0K0K1B3 111 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM262E9PQX1 116 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TSTD3H0UI37 97 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 DPM2O94777 84 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKCP01834 107 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 CRPP02741 224 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 C3orf79P0CE67 100 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 IFITM1P13164 125 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFA6P56556 154 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TSPEAR-AS2P59090 65 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 PLEKHB2Q96CS7 222 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00474Q9P2X8 69 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TP73-AS1Q9UF72 201 aa1.13□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A0G2JQZ4 141 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM238C9JI98 176 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 COX7A2LO14548 114 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFA1O15239 70 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 LEPROTO15243 131 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 NUPR1O60356 82 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFC2O95298 119 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 COX8AP10176 69 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 CRYGAP11844 174 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00313P59037 77 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 PYY3Q5JQD4 70 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 DIRC1Q969H9 104 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 DPH3Q96FX2 82 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 VAMP8Q9BV40 100 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 UQCR10Q9UDW1 63 aa1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa1.11□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa1.11□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa1.11□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 J3QQQ9 107 aa1.11□□□□□ -2.23
RABGGTB-211ENST00000489450 M0R143 59 aa1.11□□□□□ -2.23
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