RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.64□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 Q5VV11 94 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 PRR15LQ9BU68 103 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 CASC10Q5T4H9 136 aa8.63□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 LINC01556Q5JQF7 62 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 SPRR4Q96PI1 79 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.62□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP8.62□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 TNP2Q05952 138 aa8.61□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 CD164Q04900 197 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 LINC00476Q8WZB0 136 aa8.6□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 A0A087WSZ3 146 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 UBE2AP49459 152 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.59□□□□□ -1.03
NISCH-212ENST00000488380 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 H0Y9P7 68 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 LINC00588Q9Y4M8 146 aa8.58□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 A6NED7 52 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 C16orf90A8MZG2 172 aa8.57□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 LIMD2Q9BT23 127 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 COL7A1Q02388 2944 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 DNAH10OSP0CZ25 163 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.56□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 CSMD3Q7Z407 3707 aa8.55□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 IGFL1Q6UW32 110 aa8.54□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 CASC2Q6XLA1 102 aa8.53□□□□□ -1.04
NISCH-212ENST00000488380 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.52□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 SPRR1AP35321 89 aa8.51□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 K7EIL1 84 aa8.5□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 PRLHP81277 87 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 TENM2Q9NT68 2774 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 REG3GQ6UW15 175 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 LCA10Q71F78 164 aa8.49□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 DNAH7Q8WXX0 4024 aa8.48□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 A0A096LNI7 61 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 PCOTHQ58A44 107 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 COA5Q86WW8 74 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.47□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 H0Y9J4 135 aa8.46□□□□□ -1.05
NISCH-212ENST00000488380 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.46□□□□□ -1.06
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
NISCH-212ENST00000488380 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-212ENST00000488380 SPAG11AQ6PDA7 123 aa8.45□□□□□ -1.06
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.44□□□□□ -1.06
NISCH-212ENST00000488380 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.44□□□□□ -1.06
NISCH-212ENST00000488380 H3BPC8 53 aa8.43□□□□□ -1.06
NISCH-212ENST00000488380 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
NISCH-212ENST00000488380 Q75L30 129 aa8.42□□□□□ -1.06
NISCH-212ENST00000488380 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.42□□□□□ -1.06
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NISCH-212ENST00000488380 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.39□□□□□ -1.07
NISCH-212ENST00000488380 A8MWP4 228 aa8.38□□□□□ -1.07
NISCH-212ENST00000488380 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.36□□□□□ -1.07
NISCH-212ENST00000488380 A6NN06 94 aa8.36□□□□□ -1.07
NISCH-212ENST00000488380 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.36□□□□□ -1.07
NISCH-212ENST00000488380 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
NISCH-212ENST00000488380 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 MOBPQ13875 183 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.32□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 CHTF8P0CG12 524 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 SPINK7P58062 85 aa8.31□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.3□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa8.29□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.28□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
NISCH-212ENST00000488380 APLNQ9ULZ1 77 aa8.27□□□□□ -1.09
NISCH-212ENST00000488380 MDFIQ99750 246 aa8.24□□□□□ -1.09
NISCH-212ENST00000488380 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.24□□□□□ -1.09
NISCH-212ENST00000488380 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-212ENST00000488380 HRES1P13985 223 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-212ENST00000488380 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa8.23□□□□□ -1.09
NISCH-212ENST00000488380 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.22□□□□□ -1.09
NISCH-212ENST00000488380 PANO1I0J062 215 aa8.21□□□□□ -1.09
NISCH-212ENST00000488380 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.21□□□□□ -1.1
NISCH-212ENST00000488380 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
NISCH-212ENST00000488380 PRAC1Q96KF2 57 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-212ENST00000488380 CDK2AP2O75956 126 aa8.19□□□□□ -1.1
NISCH-212ENST00000488380 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.18□□□□□ -1.1
NISCH-212ENST00000488380 KMT2AQ03164 3969 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-212ENST00000488380 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.17□□□□□ -1.1
NISCH-212ENST00000488380 LINC00313P59037 77 aa8.16□□□□□ -1.1
NISCH-212ENST00000488380 SPRR1BP22528 89 aa8.15□□□□□ -1.1
NISCH-212ENST00000488380 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 FRAS1Q86XX4 4008 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 Q6ZR54 194 aa8.14□□□□□ -1.11
NISCH-212ENST00000488380 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa8.13□□□□□ -1.11
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