RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000476423.5

SZRD1-208, Transcript of SUZ RNA binding domain containing 1, human

TSL 4

Gene SZRD1, Length 567 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SZRD1-208	ENST00000476423	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	CHCHD7	Q9BUK0	85 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	SOSTDC1	Q6X4U4	206 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423		F8WEM9	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	PRR4	Q16378	134 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	MIR7-3HG	Q8N6C7	128 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423		Q1T7F1	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423	FAM19A1	Q7Z5A9	133 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A087WYN8	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	TRBV6-8	A0A0A6YYG3	113 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	ZNF561-AS1	K7EIQ3	104 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	IGLV10-54	A0A075B6I4	117 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	IGKV2-28	A0A075B6P5	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	IGKV2-29	A2NJV5	120 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	NCR3	O14931	201 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	IGKV2D-28	P01615	120 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	SLPI	P03973	132 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	SS18	Q15532	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A087WZ39	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423		Q6ZQT0	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	COX7B2	Q8TF08	81 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A1B0GW54	56 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	PRY	O14603	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A0U1RRA0	63 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	COX17	Q14061	63 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	NREP	Q16612	68 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	C9orf129	Q5T035	196 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	MRPL55	Q7Z7F7	128 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.85	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	IGLV4-60	A0A075B6I1	120 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	COX6A2	Q02221	97 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	REG3A	Q06141	175 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423		Q6ZVQ6	151 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.84	□□□□□ -1.63
SZRD1-208	ENST00000476423	IGKV2D-29	A0A075B6S2	120 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	BPY2	O14599	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	NDUFS5	O43920	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	LINC00158	P58513	81 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A096LNI7	61 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	UBE2B	P63146	152 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	NDUFB1	O75438	58 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	UBE2L6	O14933	153 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	KTN1-AS1	Q86SY8	53 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423		Q8IZM0	81 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SZRD1-208	ENST00000476423	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	VPREB1	P12018	145 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	UBE2A	P49459	152 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423		Q6ZRP5	223 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	COX7B	P24311	80 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A1B0GUV1	79 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	TOMM7	Q9P0U1	55 aa		4.73	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.72	□□□□□ -1.65
SZRD1-208	ENST00000476423		A0A1W2PNN7	141 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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