RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000473406.5

RABGGTB-209, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 721 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0G2JND7 137 aa1.68□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 GYPAP02724 150 aa1.68□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 FAUP35544 74 aaKnown RBP1.68□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TRGV9Q99603 122 aa1.68□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 CACFD1Q9UGQ2 172 aa1.68□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 MUC2Q02817 5179 aa1.68□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 MUC19Q7Z5P9 8384 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf142B7Z368 130 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PIN1P1O15428 100 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ASIPP42127 132 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa1.67□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFA5Q01523 94 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 PSMG4Q5JS54 123 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF720Q7Z2F6 126 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00472Q9H8W2 130 aa1.66□□□□□ -2.14
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 MGPP08493 103 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 SAA2P0DJI9 122 aaPredicted RBP1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 ADIRFQ15847 76 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 C10orf95Q9H7T3 257 aa1.65□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A087WWC5 75 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM223BA6NKX1 122 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 H7BZZ5 65 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 M0R3E3 92 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 NMBP08949 121 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 PMCHL1Q16048 86 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 DEFB124Q8NES8 71 aa1.64□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 CYB5AP00167 134 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 PRO1933Q9H354 126 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 ABCA13Q86UQ4 5058 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 CD163L1Q9NR16 1453 aa1.63□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 NFAT5O94916 1531 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 ST20Q9HBF5 79 aa1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP1.62□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 PLXNB2O15031 1838 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A0D9SFI3 127 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 A0A1B0GWA3 101 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 K7EP34 96 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM11AP58511 58 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 Q5BKY6 102 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 HEPN1Q6WQI6 88 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 S100A16Q96FQ6 103 aaKnown RBP1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 SPRR4Q96PI1 79 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 PLCE1Q9P212 2302 aa1.61□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 RGPD2P0DJD1 1756 aa1.6□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 CFDP00746 253 aaPredicted RBP1.6□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 ACYP1P07311 99 aa1.6□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 HAMPP81172 84 aa1.6□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 BCE1O60756 84 aa1.59□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLC2P0DOY2 106 aa1.59□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 IGLC3P0DOY3 106 aa1.59□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 ALKAL2Q6UX46 152 aa1.59□□□□□ -2.15
RABGGTB-209ENST00000473406 UMAD1C9J7I0 102 aa1.58□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 Q6JHZ5 121 aa1.58□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 FSIP2Q5CZC0 6907 aa1.58□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 MYO7BQ6PIF6 2116 aa1.58□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 C7orf77A4D0Y5 90 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 SNRPGP15A8MWD9 76 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 SPCS1Q9Y6A9 102 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 SACSQ9NZJ4 4579 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 CMYA5Q8N3K9 4069 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 ZNF815PA8K554 130 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 C18orf32Q8TCD1 76 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC01600Q96MT4 127 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 C20orf78Q9BR46 151 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 WNK2Q9Y3S1 2297 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 CSMD3Q7Z407 3707 aa1.56□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 FRAS1Q86XX4 4008 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 SFTA3P0C7M3 94 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 SMIM13P0DJ93 91 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 SPINK7P58062 85 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa1.55□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 CRCT1Q9UGL9 99 aa1.54□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 TDRG1Q3Y452 100 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 DNAH1Q9P2D7 4330 aa1.53□□□□□ -2.16
RABGGTB-209ENST00000473406 KMT2AQ03164 3969 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-209ENST00000473406 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-209ENST00000473406 ETDBQ3ZM63 59 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00643Q86TS7 51 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-209ENST00000473406 LYSTQ99698 3801 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-209ENST00000473406 SMR3AQ99954 134 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-209ENST00000473406 LINC00846Q9NV44 126 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-209ENST00000473406 HIGD1BQ9P298 99 aa1.52□□□□□ -2.17
RABGGTB-209ENST00000473406 H3BUT2 72 aa1.51□□□□□ -2.17
RABGGTB-209ENST00000473406 S100A3P33764 101 aa1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms