RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 C2orf91Q6ZV80 131 aa7.39□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 A0A0G2JQZ4 141 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 CEND1Q8N111 149 aa7.38□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa7.37□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 CFC1BP0CG36 223 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 CFC1P0CG37 223 aa7.36□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 A0A0B4J2C4 111 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 SNCGO76070 127 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00575Q6W349 94 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 SMIM29Q86T20 159 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 UQCR10Q9UDW1 63 aa7.35□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 hADV29S1A0JD25 119 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 CD164Q04900 197 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 HSD52Q0P140 79 aa7.34□□□□□ -1.23
C9orf3-212ENST00000468164 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-212ENST00000468164 PCOTHQ58A44 107 aa7.33□□□□□ -1.24
C9orf3-212ENST00000468164 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-212ENST00000468164 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.32□□□□□ -1.24
C9orf3-212ENST00000468164 F8WEM9 126 aa7.31□□□□□ -1.24
C9orf3-212ENST00000468164 FXYD2P54710 66 aa7.31□□□□□ -1.24
C9orf3-212ENST00000468164 Q6ZQY7 126 aa7.31□□□□□ -1.24
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C9orf3-212ENST00000468164 C1orf195Q5TG92 126 aa7.29□□□□□ -1.24
C9orf3-212ENST00000468164 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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C9orf3-212ENST00000468164 SMIM6P0DI80 62 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 Q5XG85 94 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 SNHG12Q9BXW3 62 aa7.26□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 PSMB2P49721 201 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 PPDPFLQ8WWR9 84 aa7.25□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 GHRHP01286 108 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 OCIAD2Q56VL3 154 aa7.24□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 K7ERJ3 54 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 COX6CP09669 75 aa7.23□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GX51 115 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 TRIAP1O43715 76 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 LCE2CQ5TA81 110 aa7.22□□□□□ -1.25
C9orf3-212ENST00000468164 Q6JHZ5 121 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 FAM218AQ96MZ4 157 aa7.21□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 IGFL1Q6UW32 110 aa7.2□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 M0R143 59 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 DNAL4O96015 105 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 CLEC2BQ92478 149 aa7.19□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 TSTD3H0UI37 97 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 SCGB1C2P0DMR2 95 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 FABP2P12104 132 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 MT1HP80294 61 aa7.17□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 H3BUT2 72 aa7.16□□□□□ -1.26
C9orf3-212ENST00000468164 H3BQ85 93 aa7.15□□□□□ -1.26
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C9orf3-212ENST00000468164 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
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C9orf3-212ENST00000468164 M0R2T5 61 aa7.12□□□□□ -1.27
C9orf3-212ENST00000468164 LST1O00453 97 aa7.11□□□□□ -1.27
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa7.1□□□□□ -1.27
C9orf3-212ENST00000468164 TRACP01848 142 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf3-212ENST00000468164 BATFQ16520 125 aa7.09□□□□□ -1.27
C9orf3-212ENST00000468164 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.08□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 Q6Q795 121 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 TEN1Q86WV5 123 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 Q96NJ1 140 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.07□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.06□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GV72 72 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 UBE2V1Q13404 147 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 ATXN8Q156A1 80 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 Q75L30 129 aa7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.04□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 A0A087WSZ3 146 aa7.03□□□□□ -1.28
C9orf3-212ENST00000468164 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.03□□□□□ -1.28
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C9orf3-212ENST00000468164 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
C9orf3-212ENST00000468164 DSCR8Q96T75 97 aa6.99□□□□□ -1.29
C9orf3-212ENST00000468164 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf3-212ENST00000468164 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1W2PNM2 257 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf3-212ENST00000468164 CCKP06307 115 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf3-212ENST00000468164 SIGMAR1Q99720 223 aa6.98□□□□□ -1.29
C9orf3-212ENST00000468164 DSCR10P59022 87 aa6.97□□□□□ -1.29
C9orf3-212ENST00000468164 VPS25Q9BRG1 176 aa6.96□□□□□ -1.3
C9orf3-212ENST00000468164 C9orf118A6NHY6 69 aa6.95□□□□□ -1.3
C9orf3-212ENST00000468164 C9JAW5 83 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf3-212ENST00000468164 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf3-212ENST00000468164 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.94□□□□□ -1.3
C9orf3-212ENST00000468164 A8MUU9 505 aa6.93□□□□□ -1.3
C9orf3-212ENST00000468164 TAX1BP3O14907 124 aa6.92□□□□□ -1.3
C9orf3-212ENST00000468164 IGKV4-1P06312 121 aa6.92□□□□□ -1.3
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