RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439128.6

NEK1-201, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 5,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-201ENST00000439128 IGSF10Q6WRI0 2623 aa7.3□□□□□ -1.24
NEK1-201ENST00000439128 A8MUN3 132 aa7.3□□□□□ -1.24
NEK1-201ENST00000439128 SPRR1AP35321 89 aa7.27□□□□□ -1.24
NEK1-201ENST00000439128 HRES1P13985 223 aa7.27□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 SPINK7P58062 85 aa7.27□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 BRCA2P51587 3418 aa7.26□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 PANO1I0J062 215 aa7.26□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 Q8NDZ9 215 aa7.26□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa7.26□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 TRANK1O15050 2925 aa7.24□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.23□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 DSPP15924 2871 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa7.22□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa7.22□□□□□ -1.25
NEK1-201ENST00000439128 SPRR1BP22528 89 aa7.21□□□□□ -1.26
NEK1-201ENST00000439128 CHD6Q8TD26 2715 aa7.19□□□□□ -1.26
NEK1-201ENST00000439128 R4GN34 69 aa7.19□□□□□ -1.26
NEK1-201ENST00000439128 WDFY4Q6ZS81 3184 aa7.19□□□□□ -1.26
NEK1-201ENST00000439128 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.19□□□□□ -1.26
NEK1-201ENST00000439128 KLKP1Q107X0 134 aa7.18□□□□□ -1.26
NEK1-201ENST00000439128 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
NEK1-201ENST00000439128 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.17□□□□□ -1.26
NEK1-201ENST00000439128 A0A087X002 238 aa7.15□□□□□ -1.26
NEK1-201ENST00000439128 Q5W150 140 aa7.15□□□□□ -1.26
NEK1-201ENST00000439128 RPS28P62857 69 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
NEK1-201ENST00000439128 A0A1B0GU33 70 aa7.15□□□□□ -1.27
NEK1-201ENST00000439128 NOTCH1P46531 2555 aa7.14□□□□□ -1.27
NEK1-201ENST00000439128 LINC00483Q53H64 154 aa7.14□□□□□ -1.27
NEK1-201ENST00000439128 PRO0628Q9UI54 55 aa7.14□□□□□ -1.27
NEK1-201ENST00000439128 A0A0C4DFX4 3053 aa7.13□□□□□ -1.27
NEK1-201ENST00000439128 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.11□□□□□ -1.27
NEK1-201ENST00000439128 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
NEK1-201ENST00000439128 H7BZZ5 65 aa7.1□□□□□ -1.27
NEK1-201ENST00000439128 LCA10Q71F78 164 aa7.09□□□□□ -1.27
NEK1-201ENST00000439128 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.09□□□□□ -1.28
NEK1-201ENST00000439128 CFAP54Q96N23 3096 aa7.08□□□□□ -1.28
NEK1-201ENST00000439128 PLAC4Q8WY50 150 aa7.08□□□□□ -1.28
NEK1-201ENST00000439128 OCR1Q9BZK8 76 aa7.08□□□□□ -1.28
NEK1-201ENST00000439128 ITPR2Q14571 2701 aa7.07□□□□□ -1.28
NEK1-201ENST00000439128 XIRP2A4UGR9 3374 aa7.06□□□□□ -1.28
NEK1-201ENST00000439128 M0QZ58 72 aa7.06□□□□□ -1.28
NEK1-201ENST00000439128 FRYQ5TBA9 3013 aa7.02□□□□□ -1.29
NEK1-201ENST00000439128 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP7.02□□□□□ -1.29
NEK1-201ENST00000439128 DMAC1Q96GE9 116 aa7.01□□□□□ -1.29
NEK1-201ENST00000439128 CDH23Q9H251 3354 aa7.01□□□□□ -1.29
NEK1-201ENST00000439128 UNC80Q8N2C7 3258 aa7.01□□□□□ -1.29
NEK1-201ENST00000439128 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.97□□□□□ -1.29
NEK1-201ENST00000439128 Q1T7F1 81 aa6.97□□□□□ -1.29
NEK1-201ENST00000439128 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.97□□□□□ -1.29
NEK1-201ENST00000439128 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.97□□□□□ -1.29
NEK1-201ENST00000439128 TRIOO75962 3097 aa6.97□□□□□ -1.29
NEK1-201ENST00000439128 REV3LO60673 3130 aa6.95□□□□□ -1.3
NEK1-201ENST00000439128 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
NEK1-201ENST00000439128 LUZP6Q538Z0 58 aa6.94□□□□□ -1.3
NEK1-201ENST00000439128 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
NEK1-201ENST00000439128 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
NEK1-201ENST00000439128 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
NEK1-201ENST00000439128 HIVEP1P15822 2718 aa6.91□□□□□ -1.3
NEK1-201ENST00000439128 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.91□□□□□ -1.3
NEK1-201ENST00000439128 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.9□□□□□ -1.3
NEK1-201ENST00000439128 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.9□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.89□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 ITPR1Q14643 2758 aa6.88□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.87□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 SZT2Q5T011 3432 aa6.87□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 TENM4Q6N022 2769 aa6.87□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.86□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 Q75L30 129 aa6.85□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
NEK1-201ENST00000439128 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.83□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 VPS13AQ96RL7 3174 aa6.83□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 TACC2O95359 2948 aa6.82□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.82□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.8□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 COL12A1Q99715 3063 aa6.8□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.8□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 ATMQ13315 3056 aa6.8□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 FLNCQ14315 2725 aa6.79□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa6.78□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 COL6A3P12111 3177 aa6.78□□□□□ -1.32
NEK1-201ENST00000439128 FRYLO94915 3013 aa6.77□□□□□ -1.33
NEK1-201ENST00000439128 A8MUU9 505 aa6.77□□□□□ -1.33
NEK1-201ENST00000439128 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
NEK1-201ENST00000439128 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.75□□□□□ -1.33
NEK1-201ENST00000439128 EYSQ5T1H1 3165 aa6.75□□□□□ -1.33
NEK1-201ENST00000439128 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.75□□□□□ -1.33
NEK1-201ENST00000439128 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.75□□□□□ -1.33
NEK1-201ENST00000439128 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa6.71□□□□□ -1.34
NEK1-201ENST00000439128 Q5XG85 94 aa6.71□□□□□ -1.34
NEK1-201ENST00000439128 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
NEK1-201ENST00000439128 A0A1B0GVY2 172 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK1-201ENST00000439128 APCP25054 2843 aa6.68□□□□□ -1.34
NEK1-201ENST00000439128 LAMA1P25391 3075 aa6.67□□□□□ -1.34
NEK1-201ENST00000439128 ROMO1P60602 79 aa6.66□□□□□ -1.34
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