RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424089.5

POLR1A-204, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 576 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-204ENST00000424089 Q9BRP9 147 aa6.33□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 J3QL48 77 aa6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 A0A087WTM6 91 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2BP63146 152 aa6.31□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP10-2P60368 255 aa6.3□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 CXCL6P80162 114 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 Q5VSD8 79 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.29□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZVQ6 151 aa6.28□□□□□ -1.4
POLR1A-204ENST00000424089 ATOX1O00244 68 aa6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 F8WEM9 126 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 ERC2-IT1O76042 136 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 CHTF8P0CG12 524 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 SPACA4Q8TDM5 124 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 DPH3Q96FX2 82 aa6.26□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 FAM229AH3BQW9 127 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 BCE1O60756 84 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 SPRR1BP22528 89 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 C1orf137Q5JT78 98 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.25□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 HAMPP81172 84 aa6.24□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 UBE2AP49459 152 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 NREPQ16612 68 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM29Q86T20 159 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 Q8NBF4 154 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 SPRR4Q96PI1 79 aa6.23□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 MYCBP2O75592 4640 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 PRLHP81277 87 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 HIGD2AQ9BW72 106 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.22□□□□□ -1.41
POLR1A-204ENST00000424089 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.21□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 A0A1W2PNM2 257 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 UQCRQO14949 82 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 CRYGAP11844 174 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 PANO1I0J062 215 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 COX7CP15954 63 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.19□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 A0A087WVE0 104 aa6.18□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP10-1P60331 282 aa6.18□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 SERP2Q8N6R1 65 aa6.18□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 CCDC179H3BU77 68 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 BPY2O14599 106 aa6.17□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 IGFL1Q6UW32 110 aa6.16□□□□□ -1.42
POLR1A-204ENST00000424089 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
POLR1A-204ENST00000424089 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
POLR1A-204ENST00000424089 FAT1Q14517 4588 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00483Q53H64 154 aa6.13□□□□□ -1.43
POLR1A-204ENST00000424089 ZNF861PO60384 105 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-204ENST00000424089 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-204ENST00000424089 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.12□□□□□ -1.43
POLR1A-204ENST00000424089 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.11□□□□□ -1.43
POLR1A-204ENST00000424089 IGKV4-1P06312 121 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-204ENST00000424089 SCXQ7RTU7 201 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-204ENST00000424089 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.1□□□□□ -1.43
POLR1A-204ENST00000424089 A0A087WSZ3 146 aa6.07□□□□□ -1.44
POLR1A-204ENST00000424089 J3KT08 172 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV7-43P04211 117 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1A-204ENST00000424089 Q6ZSA8 131 aa6.06□□□□□ -1.44
POLR1A-204ENST00000424089 OXTP01178 125 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1A-204ENST00000424089 DSCR10P59022 87 aa6.05□□□□□ -1.44
POLR1A-204ENST00000424089 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1A-204ENST00000424089 FAM30AQ9NZY2 134 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1A-204ENST00000424089 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.04□□□□□ -1.44
POLR1A-204ENST00000424089 Q8N9L7 120 aa6.03□□□□□ -1.44
POLR1A-204ENST00000424089 A0A0G2JQZ4 141 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.02□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.01□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 TMEM258P61165 79 aa6.01□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 KLKP1Q107X0 134 aa6.01□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 A8MWP4 228 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 HCG22E2RYF7 251 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 K7EQZ3 153 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFC1O43677 76 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 CD164Q04900 197 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 OCR1Q9BZK8 76 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 RNF213Q63HN8 5207 aa6□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 PRR15Q8IV56 129 aa5.99□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 C20orf197Q8N268 126 aa5.99□□□□□ -1.45
POLR1A-204ENST00000424089 NDUFB1O75438 58 aa5.98□□□□□ -1.45
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