RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402697.5

PRAME-203, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS P2 TSL 5 BASIC

Gene PRAME, Length 2,057 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-203ENST00000402697 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa8.19□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 Q8N9L7 120 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 EPM2AB3EWF7 344 aa8.18□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 LRCOL1A6NCL2 159 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 IGFL1Q6UW32 110 aa8.17□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 A0A0U1RQV1 116 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 SNURFQ9Y675 71 aa8.16□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 LCE6AA0A183 80 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 UBE2AP49459 152 aa8.15□□□□□ -1.1
PRAME-203ENST00000402697 DSCR10P59022 87 aa8.15□□□□□ -1.1
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PRAME-203ENST00000402697 PRLHP81277 87 aa8.15□□□□□ -1.11
PRAME-203ENST00000402697 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.15□□□□□ -1.11
PRAME-203ENST00000402697 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
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PRAME-203ENST00000402697 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-203ENST00000402697 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
PRAME-203ENST00000402697 HCG22E2RYF7 251 aa8.1□□□□□ -1.11
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PRAME-203ENST00000402697 A0A087WSZ3 146 aa8.07□□□□□ -1.12
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PRAME-203ENST00000402697 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-203ENST00000402697 SPACA4Q8TDM5 124 aa8.05□□□□□ -1.12
PRAME-203ENST00000402697 FAM30AQ9NZY2 134 aa8.05□□□□□ -1.12
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PRAME-203ENST00000402697 Q6ZR54 194 aa7.96□□□□□ -1.13
PRAME-203ENST00000402697 DNAH2Q9P225 4427 aa7.96□□□□□ -1.14
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PRAME-203ENST00000402697 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.14
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PRAME-203ENST00000402697 C4orf26Q17RF5 130 aa7.94□□□□□ -1.14
PRAME-203ENST00000402697 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.94□□□□□ -1.14
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PRAME-203ENST00000402697 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.9□□□□□ -1.15
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PRAME-203ENST00000402697 ALMS1Q8TCU4 4167 aa7.89□□□□□ -1.15
PRAME-203ENST00000402697 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.89□□□□□ -1.15
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PRAME-203ENST00000402697 TRAV22A0A0B4J277 110 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-203ENST00000402697 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-203ENST00000402697 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.88□□□□□ -1.15
PRAME-203ENST00000402697 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.87□□□□□ -1.15
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PRAME-203ENST00000402697 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-203ENST00000402697 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-203ENST00000402697 H0Y9P7 68 aa7.87□□□□□ -1.15
PRAME-203ENST00000402697 LINC00208Q96KT6 92 aa7.85□□□□□ -1.15
PRAME-203ENST00000402697 Q96NJ1 140 aa7.85□□□□□ -1.15
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PRAME-203ENST00000402697 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.83□□□□□ -1.16
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PRAME-203ENST00000402697 CD164Q04900 197 aa7.82□□□□□ -1.16
PRAME-203ENST00000402697 A0A1B0GVX0 72 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-203ENST00000402697 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-203ENST00000402697 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.81□□□□□ -1.16
PRAME-203ENST00000402697 IGLV7-43P04211 117 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-203ENST00000402697 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.8□□□□□ -1.16
PRAME-203ENST00000402697 Q1T7F1 81 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-203ENST00000402697 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-203ENST00000402697 V9GYY9 64 aa7.79□□□□□ -1.16
PRAME-203ENST00000402697 PRO0628Q9UI54 55 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-203ENST00000402697 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.77□□□□□ -1.17
PRAME-203ENST00000402697 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.76□□□□□ -1.17
PRAME-203ENST00000402697 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PRAME-203ENST00000402697 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.74□□□□□ -1.17
PRAME-203ENST00000402697 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-203ENST00000402697 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.74□□□□□ -1.17
PRAME-203ENST00000402697 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.74□□□□□ -1.17
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