RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-202ENST00000380828 FAM229AH3BQW9 127 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-202ENST00000380828 XAGE1AQ9HD64 81 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-202ENST00000380828 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-202ENST00000380828 RNF5Q99942 180 aa4.28□□□□□ -1.72
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 CENPEQ02224 2701 aa4.27□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV1-40P01703 118 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00575Q6W349 94 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 ITPR3Q14573 2671 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 DNHD1Q96M86 4753 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.26□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV4-30-4P0DP06 118 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 SPRR4Q96PI1 79 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GW54 56 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 ANGP03950 147 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 CRIPTQ9P021 101 aa4.25□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 ODF3BA8MYP8 253 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 MINOS1Q5TGZ0 78 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 KAAG1Q9UBP8 84 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa4.24□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6ZQY7 126 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.23□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB136Q30KP8 78 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 TLX1NBP0CAT3 122 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 USMG5Q96IX5 58 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.22□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa4.21□□□□□ -1.73
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A0J9YWU9 116 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 K7EQZ3 153 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 COX7BP24311 80 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 SMR3AQ99954 134 aa4.21□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 K7ERS5 55 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.2□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB114Q30KQ6 69 aa4.19□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 FBN3Q75N90 2809 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 MSMBP08118 114 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 HRES1P13985 223 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 SPINT4Q6UDR6 99 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A096LNI7 61 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 DSCR10P59022 87 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 KLK9Q2XQG4 91 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WTM6 91 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 A6NDX4 124 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 KMT2AQ03164 3969 aa4.18□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 ATRQ13535 2644 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 PCOTHQ58A44 107 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.17□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB4AO15263 64 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 SLURP1P55000 103 aa4.16□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.74
RABGEF1-202ENST00000380828 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.15□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GVX0 72 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 C7orf33Q8WU49 177 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 COL7A1Q02388 2944 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 Q5W150 140 aa4.14□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A1B0GU69 56 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 NUPR2A6NF83 97 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 Q6YL49 198 aa4.13□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 C1orf137Q5JT78 98 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 A0A087WSZ3 146 aa4.12□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 C5orf56Q8N8D9 126 aa4.11□□□□□ -1.75
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RABGEF1-202ENST00000380828 C10orf99Q6UWK7 81 aa4.09□□□□□ -1.75
RABGEF1-202ENST00000380828 LINC00304Q8N9R0 145 aa4.09□□□□□ -1.75
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RABGEF1-202ENST00000380828 Q96NJ1 140 aa4.08□□□□□ -1.76
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RABGEF1-202ENST00000380828 PANO1I0J062 215 aa4.08□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 H3BPC8 53 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 DMAC1Q96GE9 116 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 ZANQ9Y493 2812 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 IGLV6-57P01721 117 aa4.07□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 Q8IZM0 81 aa4.06□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 MGAM2Q2M2H8 2515 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 C15orf56Q8N910 161 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa4.05□□□□□ -1.76
RABGEF1-202ENST00000380828 DEFB135Q30KP9 77 aa4.05□□□□□ -1.76
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