RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000608272.1

LINC00963-210, long intergenic non-protein coding RNA 963, humanhuman

TSL 5

Gene LINC00963, Length 612 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00963-210ENST00000608272 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-210ENST00000608272 TMEM223A0PJW6 202 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-210ENST00000608272 NDUFC2O95298 119 aa6.75□□□□□ -1.33
LINC00963-210ENST00000608272 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
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LINC00963-210ENST00000608272 BAGE3Q86Y29 109 aa6.74□□□□□ -1.33
LINC00963-210ENST00000608272 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-210ENST00000608272 HBDP02042 147 aa6.73□□□□□ -1.33
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LINC00963-210ENST00000608272 C1orf195Q5TG92 126 aa6.73□□□□□ -1.33
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LINC00963-210ENST00000608272 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.73□□□□□ -1.33
LINC00963-210ENST00000608272 PRO1933Q9H354 126 aa6.73□□□□□ -1.33
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LINC00963-210ENST00000608272 C10orf91Q5T1B1 145 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.71□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 CHTOPQ9Y3Y2 248 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
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LINC00963-210ENST00000608272 SEC11CQ9BY50 192 aa6.7□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 FABP9Q0Z7S8 132 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.69□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 LINC00614P0C842 121 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 SMIM29Q86T20 159 aa6.68□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 AKR1D1P51857 326 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 Q75L30 129 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 URB1-AS1Q96HZ7 61 aa6.67□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 TCL1BO95988 128 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 PMCHL1Q16048 86 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.66□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 RHEBQ15382 184 aa6.65□□□□□ -1.34
LINC00963-210ENST00000608272 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 C18orf32Q8TCD1 76 aa6.64□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 MT2AP02795 61 aa6.63□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.62□□□□□ -1.35
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LINC00963-210ENST00000608272 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 TRAPPC1Q9Y5R8 145 aa6.62□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.61□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 TAL2Q16559 108 aa6.6□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 Q1RN00 199 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 C6orf99Q4VX62 202 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 IFI27L1Q96BM0 104 aa6.59□□□□□ -1.35
LINC00963-210ENST00000608272 LEPROTO15243 131 aa6.58□□□□□ -1.36
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LINC00963-210ENST00000608272 APOC3P02656 99 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 MT1FP04733 61 aa6.57□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 COX7BP24311 80 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 KRTAP10-10P60014 251 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 SPANXDQ9BXN6 97 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 SPANXCQ9NY87 97 aa6.55□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 J3QQQ9 107 aa6.54□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 SNAPINO95295 136 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 TSPEAR-AS2P59090 65 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 HERVK_113P61574 105 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 SVBPQ8N300 66 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 YPEL4Q96NS1 127 aa6.53□□□□□ -1.36
LINC00963-210ENST00000608272 PLNP26678 52 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 PCP2Q8IVA1 136 aa6.52□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.52□□□□□ -1.37
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LINC00963-210ENST00000608272 NDUFA5Q16718 116 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.51□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 H0Y8G0 127 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 LINC00518Q8N0U6 118 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 OR13C6PQ8NH95 151 aa6.5□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 A0A1B0GWB2 263 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.49□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 ZNF815PA8K554 130 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 HSBP1O75506 76 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 LCE3BQ5TA77 95 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.48□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 A4D1N5 150 aa6.47□□□□□ -1.37
LINC00963-210ENST00000608272 A0A0J9YXY3 114 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00963-210ENST00000608272 LINC00310P59036 64 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00963-210ENST00000608272 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00963-210ENST00000608272 Q6JHZ5 121 aa6.46□□□□□ -1.38
LINC00963-210ENST00000608272 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
LINC00963-210ENST00000608272 A8MUU9 505 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-210ENST00000608272 F8WEM9 126 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-210ENST00000608272 TIMM17BO60830 172 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-210ENST00000608272 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.45□□□□□ -1.38
LINC00963-210ENST00000608272 NEBP20929 6669 aa6.44□□□□□ -1.38
LINC00963-210ENST00000608272 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.44□□□□□ -1.38
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