RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602319.1

HCG18-242, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

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Gene HCG18, Length 3,342 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-242ENST00000602319 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.37□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 SPG11Q96JI7 2443 aa6.37□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 K7EQZ3 153 aa6.37□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 PSCAO43653 123 aa6.37□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.36□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.36□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 TLN2Q9Y4G6 2542 aa6.35□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 ANK2Q01484 3957 aa6.35□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 HCG22E2RYF7 251 aa6.35□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.35□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 IGSF10Q6WRI0 2623 aa6.34□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 NDUFB1O75438 58 aa6.34□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 SYCNQ0VAF6 134 aa6.34□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.34□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.34□□□□□ -1.39
HCG18-242ENST00000602319 JMJD1CQ15652 2540 aa6.34□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.33□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 PKD1L2Q7Z442 2459 aa6.33□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.33□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 APCP25054 2843 aa6.33□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 PMAIP1Q13794 54 aa6.33□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 NCOR2Q9Y618 2525 aa6.32□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.32□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 LINC01556Q5JQF7 62 aa6.32□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 MYO9AB2RTY4 2548 aa6.32□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 PTPN13Q12923 2485 aa6.32□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 NF1P21359 2839 aa6.32□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 EPG5Q9HCE0 2579 aa6.32□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 HTN3P15516 51 aa6.31□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 ITPR3Q14573 2671 aa6.31□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 H3BPC8 53 aa6.3□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 PRB1P04280 392 aa6.3□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 Q5VV11 94 aa6.3□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 J3QL48 77 aa6.3□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 LINC00588Q9Y4M8 146 aa6.3□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 CHD8Q9HCK8 2581 aa6.29□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.28□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 LINC00476Q8WZB0 136 aa6.28□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 POLQO75417 2590 aa6.28□□□□□ -1.4
HCG18-242ENST00000602319 PDZD2O15018 2839 aa6.27□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.27□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.27□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 B9D2Q9BPU9 175 aa6.27□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 LRRK2Q5S007 2527 aa6.27□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 FAM168BA1KXE4 195 aa6.27□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 PSPHP1O15172 72 aa6.27□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 IGFL1Q6UW32 110 aa6.27□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 CMYA5Q8N3K9 4069 aa6.26□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.26□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.26□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 A8MUN3 132 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 SPTBN4Q9H254 2564 aa6.25□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 MP68P56378 58 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 LIMD2Q9BT23 127 aa6.24□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 UBE2BP63146 152 aa6.23□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 REG3GQ6UW15 175 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 Q75L30 129 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 CENPEQ02224 2701 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 UBE2AP49459 152 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 CD164Q04900 197 aa6.22□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 LINC00208Q96KT6 92 aa6.21□□□□□ -1.41
HCG18-242ENST00000602319 FN1P02751 2386 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 CACNA1AO00555 2505 aa6.21□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.21□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 A8MU10 97 aa6.2□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 H0Y9P7 68 aa6.2□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.2□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 SPRR1BP22528 89 aa6.2□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 PRR4Q16378 134 aa6.2□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 C16orf90A8MZG2 172 aa6.19□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.19□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.19□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.18□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 HIVEP1P15822 2718 aa6.18□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 VWFP04275 2813 aa6.18□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 A8MWP4 228 aa6.18□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.18□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.17□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 CASC10Q5T4H9 136 aa6.17□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 CASC2Q6XLA1 102 aa6.17□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 A0A087WSZ3 146 aa6.17□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 A0A0G2JQZ4 141 aa6.17□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 A0A1W2PNN7 141 aa6.17□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa6.17□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.16□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.16□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 RETNQ9HD89 108 aa6.16□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 ZFYVE26Q68DK2 2539 aa6.16□□□□□ -1.42
HCG18-242ENST00000602319 PIEZO1Q92508 2521 aa6.16□□□□□ -1.42
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