RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578348.5

GGA3-205, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene GGA3, Length 2,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3-205ENST00000578348 PDE6GP18545 87 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.55□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 H3BQ85 93 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 H7BZZ5 65 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 Q6ZRU5 148 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 KLKP1Q107X0 134 aa7.54□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 C1orf43Q9BWL3 253 aa7.53□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 TENM3Q9P273 2699 aa7.52□□□□□ -1.2
GGA3-205ENST00000578348 SCXQ7RTU7 201 aa7.52□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 C15orf56Q8N910 161 aa7.52□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 M0R378 163 aa7.52□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 LINC00336Q6ZUF6 198 aa7.52□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 SMIM26A0A096LP01 95 aa7.51□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 CXCL6P80162 114 aa7.51□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa7.5□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 COL6A5A8TX70 2615 aa7.5□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.49□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 Q6ZRP5 223 aa7.49□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.49□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.49□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 NDUFC1O43677 76 aa7.48□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 NOTCH1P46531 2555 aa7.46□□□□□ -1.21
GGA3-205ENST00000578348 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 SNURFQ9Y675 71 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 MDFIQ99750 246 aa7.45□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 SYCNQ0VAF6 134 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 NKAPP1Q8N9T2 125 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 DEFB105AQ8NG35 78 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 RMI2Q96E14 147 aa7.44□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 ANK2Q01484 3957 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 F8WEM9 126 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 Q8N9L7 120 aa7.43□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa7.42□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 C3orf84H3BNL1 204 aa7.41□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 C7orf33Q8WU49 177 aa7.41□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 B9D2Q9BPU9 175 aa7.41□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 KCNQ1DNQ9H478 68 aa7.41□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 NREPQ16612 68 aa7.4□□□□□ -1.22
GGA3-205ENST00000578348 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 BPY2O14599 106 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 Q8N377 158 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 RPL37AP8A6NKH3 93 aa7.39□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 ERC2-IT1O76042 136 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 TLX1NBP0CAT3 122 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 PKIGQ9Y2B9 76 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 IGKV4-1P06312 121 aa7.38□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 FAM168BA1KXE4 195 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 CASC10Q5T4H9 136 aa7.37□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 MGAM2Q2M2H8 2515 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 LINC00474Q9P2X8 69 aa7.36□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 SEC61GP60059 68 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 Q6ZRX8 168 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 APLNQ9ULZ1 77 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 BRK1Q8WUW1 75 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 Q9BRP9 147 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.35□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa7.34□□□□□ -1.23
GGA3-205ENST00000578348 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa7.34□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa7.34□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP7.33□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 C1orf195Q5TG92 126 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 V9GYY9 64 aa7.33□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 PRYO14603 147 aa7.32□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 A0A1W2PNM2 257 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 C1orf137Q5JT78 98 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 OCR1Q9BZK8 76 aa7.31□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 SPRR1AP35321 89 aa7.3□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 NUPR2A6NF83 97 aa7.3□□□□□ -1.24
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GGA3-205ENST00000578348 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 UBE2BP63146 152 aa7.29□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 A0A0U1RQV1 116 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.28□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 SMIM29Q86T20 159 aa7.27□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 Q8NBF4 154 aa7.27□□□□□ -1.24
GGA3-205ENST00000578348 PSCAO43653 123 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-205ENST00000578348 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.27□□□□□ -1.25
GGA3-205ENST00000578348 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-205ENST00000578348 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-205ENST00000578348 FAM30AQ9NZY2 134 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-205ENST00000578348 STAB2Q8WWQ8 2551 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-205ENST00000578348 A0A1B0GW54 56 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-205ENST00000578348 CNBPP62633 177 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GGA3-205ENST00000578348 C14orf177Q52M58 125 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-205ENST00000578348 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.26□□□□□ -1.25
GGA3-205ENST00000578348 REG3GQ6UW15 175 aa7.24□□□□□ -1.25
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