RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567434.5

CCNDBP1-211, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 3

Gene CCNDBP1, Length 713 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-211ENST00000567434 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa9.93□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-211ENST00000567434 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-211ENST00000567434 C3orf22Q8N5N4 141 aa9.93□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-211ENST00000567434 PRO1933Q9H354 126 aa9.59□□□□□ -0.87
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CCNDBP1-211ENST00000567434 SMIM29Q86T20 159 aa9.56□□□□□ -0.88
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CCNDBP1-211ENST00000567434 F8WEM9 126 aa9.49□□□□□ -0.89
CCNDBP1-211ENST00000567434 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-211ENST00000567434 C14orf144Q96I85 54 aa9.49□□□□□ -0.89
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CCNDBP1-211ENST00000567434 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa9.48□□□□□ -0.89
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