RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567329.1

USP7-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 7, human

TSL 4

Gene USP7, Length 567 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP7-217	ENST00000567329	NREP	Q16612	68 aa		4.71	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.71	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.71	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.71	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	NOP10	Q9NPE3	64 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329		V9GYY9	64 aa		4.71	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	TRGV2	A0A075B6R0	118 aa		4.7	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	LCE6A	A0A183	80 aa		4.7	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	GIG44	P09565	113 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329		Q6ZTC4	211 aa		4.7	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.7	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	CELA1	Q9UNI1	258 aa		4.7	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	TG	P01266	2768 aa		4.69	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	BPY2	O14599	106 aa		4.69	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	COX7B	P24311	80 aa		4.69	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	ESRG	Q1W209	222 aa		4.69	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	CSNK1G2-AS1	Q8NCQ2	148 aa		4.69	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	TM2D3	Q9BRN9	247 aa		4.69	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.69	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.69	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	FUS	P35637	526 aa	Known RBP eCLIP	4.68	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.68	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329		Q1T7F1	81 aa		4.68	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.68	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.68	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.68	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		4.68	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329		M0R2N4	97 aa		4.67	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	SEC61G	P60059	68 aa		4.67	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.67	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	IGKV3OR2-268	A0A0C4DH90	116 aa		4.66	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.66	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329		Q6ZQY7	126 aa		4.66	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329		Q6ZRU5	148 aa		4.66	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	C18orf65	Q6ZTR6	163 aa		4.66	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.66	□□□□□ -1.66
USP7-217	ENST00000567329	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	DEFB136	Q30KP8	78 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	CHCHD10	Q8WYQ3	142 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	C11orf68	Q9H3H3	251 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	PRO0255	Q9UI72	69 aa		4.65	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	PRB2	P02812	416 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329		Q8NDZ9	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP17-1	Q9BYP8	105 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.63	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	SORL1	Q92673	2214 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329		M0R378	163 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	IGLV1-51	P01701	117 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	REG3A	Q06141	175 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	LINC00269	Q8N2A0	174 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	LINC01006	Q8NI28	216 aa		4.62	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	DNAJC9-AS1	A6NH13	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	LYRM9	A8MSI8	78 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	PMAIP1	Q13794	54 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	UNQ6190/PRO20217	Q6UXQ8	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	PRR34	Q9NV39	138 aa		4.61	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	DAD1	P61803	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.6	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	EPPK1	P58107	5090 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	NDUFB1	O75438	58 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	VPREB1	P12018	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	C9orf116	Q5BN46	136 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
USP7-217	ENST00000567329	EGFEM1P	Q0D2K5	195 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	LELP1	Q5T871	98 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	VWF	P04275	2813 aa		4.58	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	ANG	P03950	147 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	SCX	Q7RTU7	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329		H3BPC8	53 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329		Q6ZRP5	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	SPRR4	Q96PI1	79 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	KRTAP4-9	Q9BYQ8	210 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		4.56	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	DEFB130B	P0DP73	79 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	DEFB130A	P0DP74	79 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	CD164	Q04900	197 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329		Q75L30	129 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		4.55	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.54	□□□□□ -1.68
USP7-217	ENST00000567329	KPRP	Q5T749	579 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68

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