RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539804.1

PITX3-202, Transcript of paired like homeodomain 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PITX3, Length 1,187 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX3-202ENST00000539804 HSBP1L1C9JCN9 74 aa14.27□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa14.27□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 ANAPC11Q9NYG5 84 aa14.27□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 SMCR5Q8TEV8 140 aa14.26□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 PPDPFQ9H3Y8 114 aa14.26□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 IFITM1P13164 125 aa14.25□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 Q6ZRX8 168 aa14.25□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 HIST1H2BLQ99880 126 aa14.25□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 SPANXDQ9BXN6 97 aa14.25□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 LINC00304Q8N9R0 145 aa14.24□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa14.23□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 OR13C6PQ8NH95 151 aa14.23□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 ANKRD39Q53RE8 183 aa14.22□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 ATOH7Q8N100 152 aa14.22□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 SPAG11AQ6PDA7 123 aa14.21□□□□□ -0.13
PITX3-202ENST00000539804 C5orf52A6NGY3 159 aa14.2□□□□□ -0.14
PITX3-202ENST00000539804 TTTY13Q9BZ97 58 aa14.2□□□□□ -0.14
PITX3-202ENST00000539804 TSPAN13O95857 204 aa14.19□□□□□ -0.14
PITX3-202ENST00000539804 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
PITX3-202ENST00000539804 PRR4Q16378 134 aa14.17□□□□□ -0.14
PITX3-202ENST00000539804 LINC00483Q53H64 154 aa14.17□□□□□ -0.14
PITX3-202ENST00000539804 C4orf48Q5BLP8 95 aa14.17□□□□□ -0.14
PITX3-202ENST00000539804 GAGE2AQ6NT46 116 aa14.13□□□□□ -0.15
PITX3-202ENST00000539804 PCP2Q8IVA1 136 aa14.13□□□□□ -0.15
PITX3-202ENST00000539804 Q9BRP9 147 aa14.13□□□□□ -0.15
PITX3-202ENST00000539804 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa14.13□□□□□ -0.15
PITX3-202ENST00000539804 C3orf22Q8N5N4 141 aa14.11□□□□□ -0.15
PITX3-202ENST00000539804 SLC25A34Q6PIV7 304 aa14.09□□□□□ -0.15
PITX3-202ENST00000539804 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa14.08□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 SCGB1D1O95968 90 aa14.08□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa14.07□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 ERC2-IT1O76042 136 aa14.07□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa14.07□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 MUSTN1Q8IVN3 82 aa14.07□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 LRP2P98164 4655 aa14.05□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 A6NDN8 102 aa14.05□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 COX7BP24311 80 aa14.05□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 SPINK1P00995 79 aa14.04□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP14.04□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 C6orf99Q4VX62 202 aa14.03□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 Q8NBF4 154 aa14.03□□□□□ -0.16
PITX3-202ENST00000539804 A4D1N5 150 aa14.02□□□□□ -0.17
PITX3-202ENST00000539804 A0A1B0GWB2 263 aa14.01□□□□□ -0.17
PITX3-202ENST00000539804 UBR4Q5T4S7 5183 aa14□□□□□ -0.17
PITX3-202ENST00000539804 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa14□□□□□ -0.17
PITX3-202ENST00000539804 MOBPQ13875 183 aa13.99□□□□□ -0.17
PITX3-202ENST00000539804 RPS29P62273 56 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
PITX3-202ENST00000539804 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP13.98□□□□□ -0.17
PITX3-202ENST00000539804 C9orf153Q5TBE3 101 aa13.96□□□□□ -0.17
PITX3-202ENST00000539804 SPRR1BP22528 89 aa13.95□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 VAMP3Q15836 100 aa13.95□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa13.95□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP13.94□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 DLEU1O43261 78 aa13.93□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 COX8AP10176 69 aa13.93□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa13.92□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 TAL2Q16559 108 aa13.91□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 HIST1H4GQ99525 98 aa13.91□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa13.9□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 SLC25A20O43772 301 aa13.9□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 RETNLBQ9BQ08 111 aa13.9□□□□□ -0.18
PITX3-202ENST00000539804 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa13.89□□□□□ -0.19
PITX3-202ENST00000539804 TPRXLQ17RH7 258 aa13.89□□□□□ -0.19
PITX3-202ENST00000539804 SMIM11BQ8TCY0 68 aa13.87□□□□□ -0.19
PITX3-202ENST00000539804 VAMP8Q9BV40 100 aa13.86□□□□□ -0.19
PITX3-202ENST00000539804 SPATA45Q537H7 98 aa13.83□□□□□ -0.2
PITX3-202ENST00000539804 CDIP1Q9H305 208 aa13.83□□□□□ -0.2
PITX3-202ENST00000539804 DEFB105AQ8NG35 78 aa13.82□□□□□ -0.2
PITX3-202ENST00000539804 HIGD1BQ9P298 99 aa13.82□□□□□ -0.2
PITX3-202ENST00000539804 PAM16Q9Y3D7 125 aa13.82□□□□□ -0.2
PITX3-202ENST00000539804 LPAP08519 4548 aa13.82□□□□□ -0.2
PITX3-202ENST00000539804 LIMD2Q9BT23 127 aa13.8□□□□□ -0.2
PITX3-202ENST00000539804 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa13.79□□□□□ -0.2
PITX3-202ENST00000539804 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa13.79□□□□□ -0.2
PITX3-202ENST00000539804 C14orf144Q96I85 54 aa13.78□□□□□ -0.2
PITX3-202ENST00000539804 PRO1933Q9H354 126 aa13.78□□□□□ -0.2
PITX3-202ENST00000539804 SNCGO76070 127 aa13.76□□□□□ -0.21
PITX3-202ENST00000539804 CD164Q04900 197 aa13.76□□□□□ -0.21
PITX3-202ENST00000539804 Q8N377 158 aa13.76□□□□□ -0.21
PITX3-202ENST00000539804 Q1RN00 199 aa13.74□□□□□ -0.21
PITX3-202ENST00000539804 LINC00575Q6W349 94 aa13.74□□□□□ -0.21
PITX3-202ENST00000539804 RAB37Q96AX2 223 aa13.74□□□□□ -0.21
PITX3-202ENST00000539804 hADV29S1A0JD25 119 aa13.73□□□□□ -0.21
PITX3-202ENST00000539804 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa13.72□□□□□ -0.21
PITX3-202ENST00000539804 A6NJY4 79 aa13.72□□□□□ -0.21
PITX3-202ENST00000539804 F8WEM9 126 aa13.71□□□□□ -0.21
PITX3-202ENST00000539804 C12orf57Q99622 126 aa13.7□□□□□ -0.22
PITX3-202ENST00000539804 A0A0B4J2C4 111 aa13.68□□□□□ -0.22
PITX3-202ENST00000539804 H7C2G1 150 aa13.68□□□□□ -0.22
PITX3-202ENST00000539804 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
PITX3-202ENST00000539804 A0A0U1RQV1 116 aa13.67□□□□□ -0.22
PITX3-202ENST00000539804 PPDPFLQ8WWR9 84 aa13.67□□□□□ -0.22
PITX3-202ENST00000539804 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
PITX3-202ENST00000539804 SMIM29Q86T20 159 aa13.66□□□□□ -0.22
PITX3-202ENST00000539804 CFC1BP0CG36 223 aa13.65□□□□□ -0.22
PITX3-202ENST00000539804 CFC1P0CG37 223 aa13.65□□□□□ -0.22
PITX3-202ENST00000539804 Q6ZQY7 126 aa13.64□□□□□ -0.23
PITX3-202ENST00000539804 CEND1Q8N111 149 aa13.64□□□□□ -0.23
PITX3-202ENST00000539804 H0YGX0 51 aa13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.6 ms