RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533873.1

ACER3-213, Transcript of alkaline ceramidase 3, human

TSL 2 BASIC

Gene ACER3, Length 929 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ACER3-213	ENST00000533873	GAS8-AS1	O95177	125 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	XCL1	P47992	114 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873		Q5XG85	94 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	NRAC	Q8N912	160 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	SMIM2	Q9BVW6	85 aa		4.46	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	APOB	P04114	4563 aa	Known RBP	4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00959	A0A1B0GUT2	108 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	C11orf86	A6NJI1	115 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	PFN2	P35080	140 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	CD164L2	Q6UWJ8	174 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	C2orf48	Q96LS8	159 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	TIMM21	Q9BVV7	248 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	CDC42SE2	Q9NRR3	84 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	PYGO1	Q9Y3Y4	419 aa		4.45	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	COX7A2L	O14548	114 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	TRIAP1	O43715	76 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	RPL18A	Q02543	176 aa	Known RBP	4.44	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	C2orf66	Q6UXQ4	117 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	C5orf38	Q86SI9	138 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	DSCR8	Q96T75	97 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	UBE2D4	Q9Y2X8	147 aa		4.44	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873		J3QQQ9	107 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	LST1	O00453	97 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	LEPROT	O15243	131 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	NDUFC2	O95298	119 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	ZNF22	P17026	224 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	NPC2	P61916	151 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	SDIM1	Q6ZPB5	146 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	COPS9	Q8WXC6	57 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM141	Q96I45	108 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00474	Q9P2X8	69 aa		4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.43	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	TMEM223	A0PJW6	202 aa		4.42	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.42	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	DAND5	Q8N907	189 aa		4.42	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		4.42	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	MRPS36	P82909	103 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	SYCN	Q0VAF6	134 aa		4.41	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	CIRBP	Q14011	172 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.41	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	C7orf33	Q8WU49	177 aa		4.41	□□□□□ -1.7
ACER3-213	ENST00000533873	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV2-24	A0A0C4DH68	120 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	OXT	P01178	125 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	COX6A2	Q02221	97 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	SPAG11B	Q08648	103 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	CAMK2N2	Q96S95	79 aa		4.4	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873		A0A087WYN8	130 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	CHTF8	P0CG12	524 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873		Q6JHZ5	121 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	TIMM17A	Q99595	171 aa		4.39	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	DNAL4	O96015	105 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.38	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873		A0A096LNI7	61 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873		A0A0J9YXY3	114 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	PANO1	I0J062	215 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	NDUFA1	O15239	70 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	PRSS2	P07478	247 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	AMELX	Q99217	191 aa		4.37	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	IGHV3OR16-9	A0A0B4J2B5	98 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873		Q6ZRU5	148 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	FAT1	Q14517	4588 aa		4.36	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873		A0A087WZ39	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	BAALC-AS2	P0C853	105 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	S100A7L2	Q5SY68	101 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	LINC01561	Q8N1V8	128 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.35	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	IGIP	A6NJ69	53 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	TIMM17B	O60830	172 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	KRTAP10-4	P60372	401 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	LINC00242	Q5T6M2	205 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	BRK1	Q8WUW1	75 aa		4.34	□□□□□ -1.71
ACER3-213	ENST00000533873	PRR3	P79522	188 aa	Known RBP	4.33	□□□□□ -1.72
ACER3-213	ENST00000533873	ATP5EP2	Q5VTU8	51 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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