RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522045.5

SGCE-211, Transcript of sarcoglycan epsilon, humanhuman

TSL 3

Gene SGCE, Length 408 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCE-211ENST00000522045 TRAV7A0A075B6U4 112 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 OXTP01178 125 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 DEFB130BP0DP73 79 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 DEFB130AP0DP74 79 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 REG3AQ06141 175 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 C5orf47Q569G3 176 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 LELP1Q5T871 98 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 CLPSL2Q6UWE3 100 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 WFDC11Q8NEX6 87 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 DPH3Q96FX2 82 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 ITPR1Q14643 2758 aa2.56□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa2.55□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 FAM236CP0DP71 79 aa2.55□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 RBM3P98179 157 aaKnown RBP2.55□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 KLKP1Q107X0 134 aa2.55□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 ENHOQ6UWT2 76 aa2.55□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa2.55□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 LINC00269Q8N2A0 174 aa2.55□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 Q8NAQ8 132 aa2.55□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 DIRC1Q969H9 104 aa2.55□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 PIEZO1Q92508 2521 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 SPG11Q96JI7 2443 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 F8WDY8 70 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 H7BZZ5 65 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 ANGP03950 147 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 MIFP14174 115 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 APOC4P55056 127 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 PRR3P79522 188 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 Q5XG85 94 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 DSCR8Q96T75 97 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 C6orf48Q9UBA6 75 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 SERP1Q9Y6X1 66 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 COL12A1Q99715 3063 aa2.54□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 CFAP46Q8IYW2 2715 aa2.53□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 M0R2N4 97 aa2.53□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.53□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 ERC2-IT1O76042 136 aa2.53□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 COX7BP24311 80 aa2.53□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 DAD1P61803 113 aa2.53□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa2.53□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZQY7 126 aa2.53□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 NAV2Q8IVL1 2488 aa2.53□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa2.53□□□□□ -2
SGCE-211ENST00000522045 CHD8Q9HCK8 2581 aa2.53□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 ACACBO00763 2458 aa2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 PTPN13Q12923 2485 aa2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 A0A096LPF7 62 aa2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 H3BNG1 76 aa2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 M0R378 163 aa2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 NDUFC1O43677 76 aa2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 EGFEM1PQ0D2K5 195 aa2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 C20orf197Q8N268 126 aa2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 WFDC9Q8NEX5 89 aa2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 A0A1B0GW54 56 aa2.51□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 SPART-AS1P0CW21 52 aa2.51□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 DEFB135Q30KP9 77 aa2.51□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 C15orf56Q8N910 161 aa2.51□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 C2CD3Q4AC94 2353 aa2.5□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 TRAV10A0A0B4J240 114 aa2.5□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 J3QKU1 62 aa2.5□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 IGKV4-1P06312 121 aa2.5□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 MYO9AB2RTY4 2548 aa2.5□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP2.5□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 IGSF10Q6WRI0 2623 aa2.5□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 ZANQ9Y493 2812 aa2.5□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 USP24Q9UPU5 2620 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 SPTBN4Q9H254 2564 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 LCE6AA0A183 80 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 F8WEM9 126 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 HAMPP81172 84 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 NREPQ16612 68 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 Q6ZRU5 148 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 CAMK2N2Q96S95 79 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 KCNQ1DNQ9H478 68 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 XAGE1AQ9HD64 81 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 ZNF462Q96JM2 2506 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 CELSR2Q9HCU4 2923 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 POLQO75417 2590 aa2.49□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 MXRA5Q9NR99 2828 aa2.48□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.48□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.48□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.48□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 A0A0U1RQV1 116 aa2.48□□□□□ -2.01
SGCE-211ENST00000522045 DEFB4AO15263 64 aa2.48□□□□□ -2.01
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