RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, human

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NEK1-208	ENST00000512193	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NEK1-208	ENST00000512193	COL6A5	A8TX70	2615 aa		5.4	□□□□□ -1.54
NEK1-208	ENST00000512193	NUPR2	A6NF83	97 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193		Q6ZRX8	168 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	COL12A1	Q99715	3063 aa		5.4	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	5.39	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	SEC61G	P60059	68 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193		Q8NBF4	154 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	ZZEF1	O43149	2961 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	ITPR1	Q14643	2758 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00588	Q9Y4M8	146 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	C4orf26	Q17RF5	130 aa		5.39	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf195	Q5TG92	126 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP10-3	P60369	221 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	FAM168B	A1KXE4	195 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	5.38	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	FAM104A	Q969W3	186 aa		5.38	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	BCE1	O60756	84 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	SERTAD4-AS1	Q5TG53	156 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	PRR34	Q9NV39	138 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	EYS	Q5T1H1	3165 aa		5.37	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	5.37	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	CHTF8	P0CG12	524 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00528	Q8N1L1	170 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf64	Q8NEQ6	169 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	LRBA	P50851	2863 aa		5.36	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	PMAIP1	Q13794	54 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	REV3L	O60673	3130 aa		5.34	□□□□□ -1.55
NEK1-208	ENST00000512193	hDV103S1	A0JD37	113 aa		5.34	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		5.34	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	MDFI	Q99750	246 aa		5.34	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	C15orf56	Q8N910	161 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	EPM2A	B3EWF7	344 aa		5.33	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	MOBP	Q13875	183 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1B0GW54	56 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	KRTAP10-11	P60412	298 aa		5.32	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193		A0A0G2JQZ4	141 aa		5.31	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	TRBV7-4	A0A0J9YYF1	115 aa		5.31	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PNN7	141 aa		5.31	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	C16orf90	A8MZG2	172 aa		5.31	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193		K7EQZ3	153 aa		5.31	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193		Q8N377	158 aa		5.31	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	IGLV1-50	A0A075B6I6	118 aa		5.3	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	PRO0628	Q9UI54	55 aa		5.3	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	CR1	P17927	2039 aa		5.3	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	5.29	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	SPINK1	P00995	79 aa		5.28	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		5.28	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	LINC01600	Q96MT4	127 aa		5.28	□□□□□ -1.56
NEK1-208	ENST00000512193	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		5.27	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	CASC10	Q5T4H9	136 aa		5.27	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	KLKP1	Q107X0	134 aa		5.26	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		5.26	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193		H7BZZ5	65 aa		5.26	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	IGFL1	Q6UW32	110 aa		5.26	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	ZAN	Q9Y493	2812 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193		K7EIL1	84 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	ERC2-IT1	O76042	136 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	IGKV2-30	P06310	120 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		5.25	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	LIMD2	Q9BT23	127 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193		A0A1W2PNM2	257 aa		5.24	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	5.24	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193		K7ERS5	55 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	RTL8C	O15255	209 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	ITPR2	Q14571	2701 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		5.23	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193		A8MWP4	228 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193		Q8NDZ9	215 aa		5.22	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		5.21	□□□□□ -1.57
NEK1-208	ENST00000512193		H3BPC8	53 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	TLX1NB	P0CAT3	122 aa		5.21	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193		A8MUN3	132 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	PRR15	Q8IV56	129 aa		5.2	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		5.19	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	PLA2G2D	Q9UNK4	145 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.18	□□□□□ -1.58
NEK1-208	ENST00000512193	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	5.17	□□□□□ -1.58

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