RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496447.5

PTPRF-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRF, Length 5,887 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-215ENST00000496447 COA5Q86WW8 74 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 A0A087WTM6 91 aa8.7□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.69□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 COX6B2Q6YFQ2 88 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 C15orf56Q8N910 161 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 PRR34Q9NV39 138 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP8.68□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 A8MWP4 228 aa8.67□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 ZNF861PO60384 105 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.65□□□□□ -1.02
PTPRF-215ENST00000496447 Q5XG85 94 aa8.65□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 LINC00612Q8N6U2 182 aa8.64□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP8.63□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 LINC00528Q8N1L1 170 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 C9orf163Q8N9P6 203 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 Q1T7F1 81 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.62□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 C9orf129Q5T035 196 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 K7EQZ3 153 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 APLNQ9ULZ1 77 aa8.61□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 IGFL1Q6UW32 110 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 DSCR10P59022 87 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 C9orf92A6NGG3 77 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 UQCR11O14957 56 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa8.59□□□□□ -1.03
PTPRF-215ENST00000496447 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.59□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 TLX1NBP0CAT3 122 aa8.58□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 MGAM2Q2M2H8 2515 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 IGLV7-43P04211 117 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa8.56□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.55□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 ZNF575Q86XF7 245 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 CASC10Q5T4H9 136 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa8.54□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 A0A1W2PNN7 141 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 USP24Q9UPU5 2620 aa8.53□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 MIR22HGQ0VDD5 57 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 Q8N377 158 aa8.52□□□□□ -1.04
PTPRF-215ENST00000496447 A0A1B0GVX0 72 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRF-215ENST00000496447 CNBPP62633 177 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRF-215ENST00000496447 A0A0G2JQZ4 141 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRF-215ENST00000496447 SPRR4Q96PI1 79 aa8.47□□□□□ -1.05
PTPRF-215ENST00000496447 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
PTPRF-215ENST00000496447 OCR1Q9BZK8 76 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRF-215ENST00000496447 CRIPTQ9P021 101 aa8.46□□□□□ -1.05
PTPRF-215ENST00000496447 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa8.45□□□□□ -1.06
PTPRF-215ENST00000496447 TNP2Q05952 138 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRF-215ENST00000496447 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.43□□□□□ -1.06
PTPRF-215ENST00000496447 H3BS24 57 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRF-215ENST00000496447 Q75L30 129 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRF-215ENST00000496447 LINC01554Q52M75 96 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-215ENST00000496447 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRF-215ENST00000496447 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-215ENST00000496447 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-215ENST00000496447 OXTP01178 125 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRF-215ENST00000496447 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRF-215ENST00000496447 A0A1W2PNM2 257 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRF-215ENST00000496447 MAST4O15021 2626 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-215ENST00000496447 ATRQ13535 2644 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRF-215ENST00000496447 ITPR3Q14573 2671 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRF-215ENST00000496447 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRF-215ENST00000496447 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
PTPRF-215ENST00000496447 Q6ZSA8 131 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRF-215ENST00000496447 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRF-215ENST00000496447 BPTFQ12830 3046 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRF-215ENST00000496447 Q8N1X5 172 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRF-215ENST00000496447 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRF-215ENST00000496447 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRF-215ENST00000496447 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRF-215ENST00000496447 Q5VV11 94 aa8.27□□□□□ -1.09
PTPRF-215ENST00000496447 DNAH12Q6ZR08 3092 aa8.24□□□□□ -1.09
PTPRF-215ENST00000496447 FAM104AQ969W3 186 aa8.23□□□□□ -1.09
PTPRF-215ENST00000496447 A0A0D9SG42 100 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRF-215ENST00000496447 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.2□□□□□ -1.1
PTPRF-215ENST00000496447 LUZP6Q538Z0 58 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRF-215ENST00000496447 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRF-215ENST00000496447 PRAC1Q96KF2 57 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRF-215ENST00000496447 M0R2T5 61 aa8.18□□□□□ -1.1
PTPRF-215ENST00000496447 CR1P17927 2039 aa8.12□□□□□ -1.11
PTPRF-215ENST00000496447 UTRNP46939 3433 aa8.11□□□□□ -1.11
PTPRF-215ENST00000496447 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.09□□□□□ -1.11
PTPRF-215ENST00000496447 CSAG1Q6PB30 78 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRF-215ENST00000496447 CEP350Q5VT06 3117 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-215ENST00000496447 LCE6AA0A183 80 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-215ENST00000496447 SPINK7P58062 85 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-215ENST00000496447 STAB1Q9NY15 2570 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-215ENST00000496447 Q5VSD8 79 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRF-215ENST00000496447 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
PTPRF-215ENST00000496447 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.04□□□□□ -1.12
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