RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
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PRPF40A-211ENST00000493468 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa7.44□□□□□ -1.22
PRPF40A-211ENST00000493468 NDUFC2O95298 119 aa7.44□□□□□ -1.22
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PRPF40A-211ENST00000493468 S100A7L2Q5SY68 101 aa7.44□□□□□ -1.22
PRPF40A-211ENST00000493468 S100PP25815 95 aa7.43□□□□□ -1.22
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PRPF40A-211ENST00000493468 MIEN1Q9BRT3 115 aa7.4□□□□□ -1.22
PRPF40A-211ENST00000493468 PRO1933Q9H354 126 aa7.4□□□□□ -1.22
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PRPF40A-211ENST00000493468 RPS10P5Q9NQ39 176 aa7.35□□□□□ -1.23
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PRPF40A-211ENST00000493468 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.31□□□□□ -1.24
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PRPF40A-211ENST00000493468 C20orf202A1L168 122 aa7.3□□□□□ -1.24
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PRPF40A-211ENST00000493468 UQCC3Q6UW78 93 aa7.3□□□□□ -1.24
PRPF40A-211ENST00000493468 Q75L30 129 aa7.3□□□□□ -1.24
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PRPF40A-211ENST00000493468 HERVK_113P61574 105 aa7.24□□□□□ -1.25
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PRPF40A-211ENST00000493468 F8WEM9 126 aa7.1□□□□□ -1.27
PRPF40A-211ENST00000493468 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PRPF40A-211ENST00000493468 Q6JHZ5 121 aa7.09□□□□□ -1.27
PRPF40A-211ENST00000493468 CLEC2BQ92478 149 aa7.09□□□□□ -1.27
PRPF40A-211ENST00000493468 HSPB8Q9UJY1 196 aa7.09□□□□□ -1.27
PRPF40A-211ENST00000493468 LCE3BQ5TA77 95 aa7.08□□□□□ -1.28
PRPF40A-211ENST00000493468 IGFL1Q6UW32 110 aa7.08□□□□□ -1.28
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.07□□□□□ -1.28
PRPF40A-211ENST00000493468 FAM236CP0DP71 79 aa7.07□□□□□ -1.28
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