RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	PPDPF	Q9H3Y8	114 aa		10.34	□□□□□ -0.75
HDAC10-216	ENST00000489424	COX8A	P10176	69 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	SPATA45	Q537H7	98 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	PAM16	Q9Y3D7	125 aa		10.33	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	HINT1	P49773	126 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	DLEU1	O43261	78 aa		10.31	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		10.31	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		10.31	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV6-57	P01721	117 aa		10.3	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV23DV6	A0A075B6W5	121 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	PRLH	P81277	87 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		10.29	□□□□□ -0.76
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRR1A	P35321	89 aa		10.27	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		10.27	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	C14orf144	Q96I85	54 aa		10.27	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	HIST1H4G	Q99525	98 aa		10.27	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	CRYGA	P11844	174 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	CTAG1A	P78358	180 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	HIGD2A	Q9BW72	106 aa		10.26	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NDN8	102 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		10.25	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF73	O43830	326 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	PYY3	Q5JQD4	70 aa		10.24	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	10.24	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424		B5MCH6	92 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	HIGD1B	Q9P298	99 aa		10.22	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	10.21	□□□□□ -0.77
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF213	Q63HN8	5207 aa		10.21	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424		Q6ZRX8	168 aa		10.2	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	SMCR5	Q8TEV8	140 aa		10.19	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A087X002	238 aa		10.18	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424		A4D1N5	150 aa		10.18	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	COX7B	P24311	80 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	TAL2	Q16559	108 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		10.16	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	VAMP3	Q15836	100 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	C6orf99	Q4VX62	202 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	LPA	P08519	4548 aa		10.15	□□□□□ -0.78
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM238L	A0A1B0GVL6	79 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NJY4	79 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRR4	Q96PI1	79 aa		10.14	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	UQCR10	Q9UDW1	63 aa		10.13	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A1B0GWB2	263 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	RAB37	Q96AX2	223 aa		10.12	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	ELOF1	P60002	83 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424		Q9BRP9	147 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		10.11	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	PRR4	Q16378	134 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	CEND1	Q8N111	149 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		10.1	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	GAGE2A	Q6NT46	116 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	C12orf57	Q99622	126 aa		10.09	□□□□□ -0.79
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC25A20	O43772	301 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	SMIM6	P0DI80	62 aa		10.08	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	ERC2-IT1	O76042	136 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	HSD52	Q0P140	79 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		10.07	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	CFC1B	P0CG36	223 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	CFC1	P0CG37	223 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	SPAG11A	Q6PDA7	123 aa		10.06	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0B4J2C4	111 aa		10.05	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN13	O95857	204 aa		10.05	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00483	Q53H64	154 aa		10.05	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		10.05	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424		H7C2G1	150 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	SNCG	O76070	127 aa		10.03	□□□□□ -0.8
HDAC10-216	ENST00000489424		Q1RN00	199 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	C4orf48	Q5BLP8	95 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		10.02	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		10	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	FXYD2	P54710	66 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	C3orf22	Q8N5N4	141 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		9.99	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	PRO1933	Q9H354	126 aa		9.98	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	LOC105371267	A0A1B0GV96	52 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	hADV29S1	A0JD25	119 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424		H0YGX0	51 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	LINC00575	Q6W349	94 aa		9.97	□□□□□ -0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	TSTD3	H0UI37	97 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	TPRXL	Q17RH7	258 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		9.96	□□□□□ -0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	SPRR1B	P22528	89 aa		9.95	□□□□□ -0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	MOBP	Q13875	183 aa		9.95	□□□□□ -0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	9.93	□□□□□ -0.82
HDAC10-216	ENST00000489424		Q8NBF4	154 aa		9.93	□□□□□ -0.82
HDAC10-216	ENST00000489424		M0R143	59 aa		9.92	□□□□□ -0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	SPINK1	P00995	79 aa		9.92	□□□□□ -0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMB2	P49721	201 aa		9.92	□□□□□ -0.82
HDAC10-216	ENST00000489424	COX6C	P09669	75 aa		9.91	□□□□□ -0.82

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