RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 DLEU1O43261 78 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 TIMM17BO60830 172 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 C14orf144Q96I85 54 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 MIEN1Q9BRT3 115 aa11.23□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 COPS9Q8WXC6 57 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 UBR4Q5T4S7 5183 aa11.22□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 LRP2P98164 4655 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 LINC00518Q8N0U6 118 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 TTTY13Q9BZ97 58 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 UQCR10Q9UDW1 63 aa11.21□□□□□ -0.61
NISCH-209ENST00000485765 IGLV6-57P01721 117 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-209ENST00000485765 DDTP30046 118 aa11.2□□□□□ -0.62
NISCH-209ENST00000485765 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-209ENST00000485765 HIGD2AQ9BW72 106 aa11.19□□□□□ -0.62
NISCH-209ENST00000485765 NPC2P61916 151 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-209ENST00000485765 LINC00308Q8TCZ7 52 aa11.18□□□□□ -0.62
NISCH-209ENST00000485765 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa11.17□□□□□ -0.62
NISCH-209ENST00000485765 B5MCH6 92 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-209ENST00000485765 Q6ZVH6 145 aa11.16□□□□□ -0.62
NISCH-209ENST00000485765 SPRR4Q96PI1 79 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-209ENST00000485765 PRO1933Q9H354 126 aa11.15□□□□□ -0.62
NISCH-209ENST00000485765 S100A7L2Q5SY68 101 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 SMCR5Q8TEV8 140 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 SPANXCQ9NY87 97 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 HIGD1BQ9P298 99 aa11.14□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 HIST1H4GQ99525 98 aa11.13□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 SPANXDQ9BXN6 97 aa11.12□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 IFITM1P13164 125 aa11.11□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa11.1□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 TSPAN13O95857 204 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 Q6ZRX8 168 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 Q9BRP9 147 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 PPDPFQ9H3Y8 114 aa11.09□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 LPAP08519 4548 aa11.08□□□□□ -0.63
NISCH-209ENST00000485765 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 TAL2Q16559 108 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 CBY1Q9Y3M2 126 aa11.08□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 ERC2-IT1O76042 136 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 CTAG1AP78358 180 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 LINC00483Q53H64 154 aa11.07□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 C2orf91Q6ZV80 131 aa11.06□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 LINC00304Q8N9R0 145 aa11.06□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 A6NJY4 79 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 HSD52Q0P140 79 aa11.05□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 OR13C6PQ8NH95 151 aa11.04□□□□□ -0.64
NISCH-209ENST00000485765 MUSTN1Q8IVN3 82 aa11.02□□□□□ -0.65
NISCH-209ENST00000485765 M0R143 59 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-209ENST00000485765 PRR4Q16378 134 aa11.01□□□□□ -0.65
NISCH-209ENST00000485765 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP11□□□□□ -0.65
NISCH-209ENST00000485765 GAGE2AQ6NT46 116 aa11□□□□□ -0.65
NISCH-209ENST00000485765 CEND1Q8N111 149 aa11□□□□□ -0.65
NISCH-209ENST00000485765 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.99□□□□□ -0.65
NISCH-209ENST00000485765 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP10.95□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 A4D1N5 150 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 PCP4L1A6NKN8 68 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 C6orf99Q4VX62 202 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 Q8NBF4 154 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 RAB37Q96AX2 223 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa10.94□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa10.93□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa10.93□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 A6NDN8 102 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 COX7BP24311 80 aa10.92□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.91□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 SPRR1BP22528 89 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.9□□□□□ -0.66
NISCH-209ENST00000485765 RNF213Q63HN8 5207 aa10.89□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 FXYD2P54710 66 aa10.89□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 MOBPQ13875 183 aa10.89□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 A0A0B4J2C4 111 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 SPINK1P00995 79 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 BATFQ16520 125 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa10.88□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 A0A1B0GWB2 263 aa10.86□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 Q1RN00 199 aa10.85□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 SMIM11BQ8TCY0 68 aa10.85□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 PRO1854Q9UHT4 67 aa10.85□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 CFC1BP0CG36 223 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 CFC1P0CG37 223 aa10.84□□□□□ -0.67
NISCH-209ENST00000485765 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
NISCH-209ENST00000485765 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.82□□□□□ -0.68
NISCH-209ENST00000485765 TPRXLQ17RH7 258 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-209ENST00000485765 C9orf153Q5TBE3 101 aa10.8□□□□□ -0.68
NISCH-209ENST00000485765 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
NISCH-209ENST00000485765 H7C2G1 150 aa10.79□□□□□ -0.68
NISCH-209ENST00000485765 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-209ENST00000485765 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP10.78□□□□□ -0.68
NISCH-209ENST00000485765 VAMP3Q15836 100 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-209ENST00000485765 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa10.78□□□□□ -0.68
NISCH-209ENST00000485765 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa10.77□□□□□ -0.69
NISCH-209ENST00000485765 K7ERJ3 54 aa10.77□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms