RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481231.5

SMARCE1-210, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 695 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-210ENST00000481231 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP5.16□□□□□ -1.58
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV6-57P01721 117 aa5.15□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP5.14□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 H0Y8G0 127 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 PCOTHQ58A44 107 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa5.13□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 LEPROTO15243 131 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 S100A7L2Q5SY68 101 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.12□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 J3QQQ9 107 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 HSBP1O75506 76 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFC2O95298 119 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 APOC3P02656 99 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 YPEL4Q96NS1 127 aa5.11□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 C9orf92A6NGG3 77 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 PLNP26678 52 aa5.1□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 C5orf52A6NGY3 159 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 NMUP48645 174 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 NPC2P61916 151 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 HRCT1Q6UXD1 115 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa5.09□□□□□ -1.59
SMARCE1-210ENST00000481231 DPM2O94777 84 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 LEPROTL1O95214 131 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 SNAPINO95295 136 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 SPRR1BP22528 89 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00310P59036 64 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 HERVK_113P61574 105 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 SVBPQ8N300 66 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 PMCHL2Q9BQD1 86 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 LIMD2Q9BT23 127 aa5.08□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0J9YXY3 114 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 SERF1AO75920 110 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 NDUFA5Q16718 116 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.06□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 IGKCP01834 107 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 SLC25A34Q6PIV7 304 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 HSPB8Q9UJY1 196 aa5.05□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 FABP4P15090 132 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 CBY1Q9Y3M2 126 aa5.04□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 TRGC2P03986 189 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 OR13C6PQ8NH95 151 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00308Q8TCZ7 52 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 LITAFQ99732 161 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 SPANXCQ9NY87 97 aa5.03□□□□□ -1.6
SMARCE1-210ENST00000481231 E9PLD3 99 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 H7C2G1 150 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 CD164Q04900 197 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 Q1RN00 199 aa5.02□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 COX7BP24311 80 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 C1orf195Q5TG92 126 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 DEFB105AQ8NG35 78 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 SPANXDQ9BXN6 97 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 PRO1933Q9H354 126 aa5.01□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 TAL2Q16559 108 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 C6orf99Q4VX62 202 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 Q5XG85 94 aa5□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 TIMM17BO60830 172 aa4.99□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A0G2JQZ4 141 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 CFC1P0CG37 223 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 SMIM29Q86T20 159 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.98□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 AKR1D1P51857 326 aa4.97□□□□□ -1.61
SMARCE1-210ENST00000481231 ZNF815PA8K554 130 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC00518Q8N0U6 118 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-210ENST00000481231 TTTY13Q9BZ97 58 aa4.96□□□□□ -1.62
SMARCE1-210ENST00000481231 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-210ENST00000481231 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-210ENST00000481231 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa4.95□□□□□ -1.62
SMARCE1-210ENST00000481231 A0A1B0GWB2 263 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-210ENST00000481231 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-210ENST00000481231 LINC01545Q5VT33 79 aa4.93□□□□□ -1.62
SMARCE1-210ENST00000481231 COLCA2A8K830 154 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-210ENST00000481231 TCL1BO95988 128 aa4.92□□□□□ -1.62
SMARCE1-210ENST00000481231 A6NDN8 102 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-210ENST00000481231 Q6Q795 121 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-210ENST00000481231 PET117Q6UWS5 81 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-210ENST00000481231 NEBP20929 6669 aa4.9□□□□□ -1.63
SMARCE1-210ENST00000481231 A4D1N5 150 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-210ENST00000481231 SCGB1D4Q6XE38 83 aa4.89□□□□□ -1.63
SMARCE1-210ENST00000481231 HIST1H2BKO60814 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-210ENST00000481231 HIST1H2BJP06899 126 aa4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-210ENST00000481231 IFITM1P13164 125 aa4.88□□□□□ -1.63
SMARCE1-210ENST00000481231 HIST1H2BOP23527 126 aa4.88□□□□□ -1.63
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